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文檔簡介
1、漢坦病毒(Hantavirus,HV)是一種有包膜分節(jié)段的負鏈RNA病毒,屬布尼亞病毒科。HV的自然宿主為嚙齒類動物。其對嚙齒類只造成一過性感染,并不影響其宿主的壽命和繁衍。但其可通過野生嚙齒類宿主的排泄物如唾液、尿和糞便等感染人類,并引發(fā)兩種嚴重的臨床疾病:腎綜合征出血熱(hemorrhgic fever with renal syndrome,HFRS)和漢坦病毒肺綜合癥(hantavirus cardiopulmonary syn
2、drome,HPS)。中國擁有世界上最高的HFRS發(fā)病率,而黑龍江是最嚴重的疫區(qū)之一。
進行疫病監(jiān)測和流行病學研究,是有效防控疫病的重要基礎(chǔ)。黑龍江省與俄聯(lián)邦、蒙古等多國接壤,是動物疫病跨國傳播的重要防控區(qū)域,而口岸地區(qū)人員、貨物交流頻繁,又會提升動物疫病傳播的風險。開展口岸地區(qū)疫病監(jiān)測和流行病學研究,尤其具有其重要性。因此,本研究對2014年黑龍江省主要口岸城市漢坦病毒在自然宿主中的流行情況進行了調(diào)查,并重點對從嚙齒類動物體
3、內(nèi)分離的HV進行了分子流行病學研究。
本研究中,共在黑龍江地區(qū)選取12個口岸城市,捕獲嚙齒動物645只,其中主要為11種嚙齒目動物,此外包括4只鼩鼱(Sorex araneus Linnaeus)。在捕獲的嚙齒目動物中,數(shù)量最多的是黑線姬鼠(Apodemus agrarius),其次是褐家鼠(Rattusnorvegicus)。對上述捕獲的動物進行PCR檢測以確定HV感染情況。結(jié)果表明黑線姬鼠中HV的有感染率是4.9%(14/
4、282),而褐家鼠的HV感染率是8.3%(15/180)。進一步完成的基于基因序列測定和遺傳進化分析結(jié)果表明,分離到的HV中,包含兩種HV基因型:漢灘病毒(Hantaan virus,HTNV)和漢城病毒(Seoul virus,SEOV)。其中HTNV有10株,SEOV有19株,SEOV感染的檢出率略高于HTNV。而遺傳進化樹分析表明,黑龍江口岸地區(qū)流行的SEOV和HTNV各存在兩個和一個進化分支,與之前報道的檢測結(jié)果相一致,未檢測到
5、有新進化分支的出現(xiàn)。為了更好地了解在黑龍江口岸地區(qū)HV的流行情況,我們獲得了一株分離于褐家鼠的TJ分離株(HTNV)的M序列全長和一株DN2分離株(SEOV)的全基因組序列,來分析其基因信息。其中,HTNV的M基因氨基酸序列與國內(nèi)外參考毒株對比后,并未發(fā)現(xiàn)有重要氨基酸位點突變。而DN2分離株與國內(nèi)外代表毒株SEOV L99的核苷酸同源率是:S基因96.5%,M基因98.3%,L基因96.0%。氨基酸序列的同源率為:S基因93.3%,M基
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