29189.抗癌藥物敏感性預測的網絡流模型

1、上海師范大學學位論文中文摘要摘要癌癥是由控制細胞生長機制異常引起的，基因突變，染色體變異，拷貝數(shù)變異等都會引發(fā)癌癥抗癌藥物多種多樣，抗癌藥物的敏感性研究具有重大意義考慮到基因之間的調控作用，本文提出了一種網絡流模型預測抗癌藥物敏感性的方法在此模型中，基因之間原本存在調控作用，假定基因突變，拷貝數(shù)變異會對網絡流中基因之間的調控作用產生一定的影響抗癌藥物通過作用某一特定的目標靶基因，以此降低細胞通路的活性我們以實施藥物前后通路活性差值的大小

2、作為衡量某一種藥物敏感性的指標基于該假設，我們構造了一個滿足所有樣本參數(shù)的模型，通過交叉驗證的方法，此模型具有較好的預測結果在MAPK通路中，我們得到不同的癌癥相關基因對不同藥物的敏感性以及不同的藥物對不同癌癥相關基因的藥物作用根據(jù)我們的結果，雖然指向同一靶基因的抑制劑有相似的藥物作用，但是它們有不同的抑制機制通過10輪交叉驗證的方法，BRAF和MEK抑制劑預測值與真實值的皮爾遜相關系數(shù)大約是O4，這個結果和彈性網模型的結果是可以比較的

3、并非使用龐大的基因數(shù)據(jù)特征，包含轉錄分析，基因突變和拷貝數(shù)變異我們的特征僅僅是基于MAPK通路的致癌基因的突變和拷貝數(shù)變異因此我們得結果是相當可觀的，并且具有較好的泛化能力此外，不同藥物作用整合在同一個模型中，我們可以預測藥物組合的敏感性關鍵詞彈性網絡模型網絡流模型通路活性抗癌藥物敏感性目錄目錄摘要IAbstractII第1章緒論411課題背景4第2章抗癌藥物敏感性預測的常用方法5第3章抗癌藥物敏感性預測的彈性網絡模型6第4章抗癌藥物敏