豬BMP15、GDF9和FSHβ基因的遺傳多態(tài)性與產(chǎn)仔數(shù)的相關(guān)性研究.pdf

1、本研究利用PCR和PCR-SSCP技術(shù)對大白豬、長白豬、杜洛克、遼寧黑豬、丹育黑豬5個豬群共167頭的BMP15基因、GDF9基因和FSHβ亞基基因檢測多態(tài)性，研究基因和豬產(chǎn)仔數(shù)之間的關(guān)系。利用GenBank上已經(jīng)發(fā)表的豬的基因序列設(shè)計(jì)引物，進(jìn)行PCR擴(kuò)增并測序，多態(tài)分析，和對兩個插入序列進(jìn)行生物信息學(xué)分析，并對產(chǎn)仔數(shù)建立GLM模型，探討兩個多態(tài)性與豬產(chǎn)仔數(shù)的關(guān)系。結(jié)果表明：
　　 (1)BMP15基因的多態(tài)性檢測：設(shè)計(jì)2條引物

2、（引物1和引物2）擴(kuò)增，共檢測到3個突變：5582C/T(TCC-TCT)、6031 T/C(AAT-AAC）和6056C/T(AAC-AAT)。6031 T/C(AAT-AAC），為同意突變，在遼寧黑豬中檢測到T。
　　 (2)GDF9基因的多態(tài)性檢測及與產(chǎn)仔數(shù)性狀的相關(guān)性分析：設(shè)計(jì)5條引物（引物3、引物4、引物5、引物6和引物7）擴(kuò)增，引物3序列檢測到1個約300bp序列的插入/缺失多態(tài)。引物4序列檢測到遼寧黑豬存在2個雜合

3、突變：3422C/T，其它豬種均為C；3427 C/T，其它豬種均為T，且這兩個突變距離很近。引物5序列檢測到2個多態(tài)：遼寧黑豬存在雜合，其它豬均為純和。引物6序列檢測到6個多態(tài)，其中還有1個杜洛克3bp序列的缺失。引物7序列的突變同引物6，設(shè)計(jì)短序列主要為了使用SSCP技術(shù)檢測品種間差異。對插入/缺失多態(tài)與產(chǎn)仔數(shù)進(jìn)行相關(guān)性分析，研究表明不同品種、胎次、基因型，產(chǎn)仔數(shù)不同基因型之間差異不顯著（P>0.05）。
　　 (3)FSH

4、β基因的多態(tài)性檢測及與產(chǎn)仔數(shù)性狀的相關(guān)性分析：設(shè)計(jì)1條引物擴(kuò)增，發(fā)現(xiàn)存在1個約300bp序列的插入/缺失多態(tài)。本研究表明不同品種、胎次、基因型，產(chǎn)仔數(shù)差異極顯著（P<0.01），BB型純合子比AA型純合子多產(chǎn)1.3頭。
　　 (4)GDF9基因和FSHβ基因Alu序列插入/缺失的多態(tài)性與產(chǎn)仔數(shù)性狀的相關(guān)性分析：使用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Polymerase chain reaction，PCR)對遼寧黑豬、長白、大約克、丹育豬和杜洛克

5、的FSHβ亞基基因和GDF9基因的插入片段擴(kuò)增進(jìn)行多態(tài)分析，和對兩個插入序列進(jìn)行生物信息學(xué)分析，并對產(chǎn)仔數(shù)建立GLM模型，探討兩個多態(tài)性與豬產(chǎn)仔數(shù)的關(guān)系。結(jié)果發(fā)現(xiàn)FSHβ亞基基因和GDF9基因以某種方式相互結(jié)合影響豬產(chǎn)仔數(shù)，這可能會作為豬產(chǎn)仔數(shù)性狀的遺傳標(biāo)記。首次證明FSHβ亞基基因與GDF9基因在遼寧黑豬、長白、大約克、丹育豬和杜洛克豬種中與控制豬產(chǎn)仔數(shù)的主效基因緊密連鎖。優(yōu)勢基因型BBDD純合子比AACC型純合子母豬平均每胎多產(chǎn)仔1