豬轉化生長因子β1基因多態(tài)性與豬產(chǎn)仔數(shù)關系的研究.pdf

1、轉化生長因子β1(TGF-β1)是轉化生長因子家族的重要成員，具有促進細胞生長、分化、遷移、免疫調節(jié)和細胞外間質(ECM)形成等作用。本研究以豬TGF-β1基因作為影響豬產(chǎn)仔數(shù)性狀的候選基因，選用大白豬、長白豬、皮特蘭豬、圣特西豬和二花臉豬為實驗材料，利用單核苷酸構象多態(tài)性(SSCP)方法對豬TGF-β1基因進行單核苷酸多態(tài)性的檢測與分析，探討其作為影響豬產(chǎn)仔數(shù)性狀的候選基因的可能性。　　首先利用本實驗室構建的豬BAC文庫TGF-β1

2、陽性克隆測序獲得第2外顯子兩端側翼序列、第3外顯子3’端、第5外顯子3’端的側翼序列，對TGF-β1基因cDNA序列和內含子4、內含子6進行了SSCP檢測與分析，發(fā)現(xiàn)5個SNP：第四內含子32處(GenBank序列號：AF461809)C→T突變，第六內含子179處G→A突變、1043處C→T突變(GenBank序列號：AJ621785)，和3’非翻譯區(qū)2490和2494處GG→AA連鎖突變(GenBank序列號：M23703)。將5個

3、SNPs做單倍型處理后，群體中主要存在兩種單倍型：CGCAA(記為A)，和TATGG(記為K)。對不同豬種的單倍型頻率統(tǒng)計發(fā)現(xiàn)，在大白豬、長白豬、皮特蘭豬和圣特西豬中等引入豬種中，單倍型A為優(yōu)勢等位基因，在中國地方良種二花臉中，單倍型K為優(yōu)勢等位基因。建立線性模型：Y=u+場年季效應+TGF-β1單倍型構成效應+殘差，估計各單倍型構成對大白豬產(chǎn)仔數(shù)的影響效應。說明KK型對母豬頭胎總產(chǎn)仔數(shù)有較大的影響。各單倍型構成對頭胎產(chǎn)活仔數(shù)和二胎產(chǎn)仔