鴨遺傳圖譜的構建及重要經(jīng)濟性狀基因座的初步定位.pdf

1、鴨遺傳圖譜的構建是重要經(jīng)濟性狀基因座(QTL)定位及其主效基因克隆研究中不可缺少的部分,而后者又為鴨遺傳改良提供理論依據(jù).然而,至今未見關于鴨遺傳圖譜構建及QTL定位的研究報道.該文旨在通過構建鴨微衛(wèi)星富集文庫克隆大量微衛(wèi)星DNA序列,利用克隆的序列設計引物,并通過PCR擴增及其擴增片段大小的分析,檢測來源于兩個北京鴨品系的三代群體基因型,在此基礎上通過遺傳連鎖分析構建鴨第一張遺傳圖譜,并應用區(qū)間定位方法發(fā)現(xiàn)一些對生長、屠體及肉質性狀具

2、有顯著作用的QTL.該研究應用鏈親和素捕捉方法構建了富集(CA)n、(CAG)n、(GCC)n及(TTTC)n重復類型的鴨混合型微衛(wèi)星富集文庫,序列測定結果表明,1181個隨機克隆中832個含有10bp以上核心序列,571個克隆核心序列≥15bp,富集率為73.18﹪,平均插入片段長度為372.87bp;完全型、不完全型、復合型及其它類型微衛(wèi)星的比例分別是65.29﹪、13.29﹪、8.25﹪及13.17﹪,完全型中(AC)n、(GCA

3、)n、(GCC)n及(TTTC)n類型重復微衛(wèi)星的比例分別是64.56﹪、12.81﹪、1.58﹪及5.96﹪;不完全型中上述四種重復類型微衛(wèi)星的比例分別是70.69﹪、6.03﹪、13.29﹪和8.25﹪.選擇核心序列≥15bp的微衛(wèi)星DNA序列,利用直接熒光標記或M13間接熒光標記的方法共合成300對引物,通過多重PCR反應條件的優(yōu)化,篩選出了138對可用于大規(guī)?；蛐头治龅囊?根據(jù)優(yōu)化好的PCR條件,選擇12個全同胞家系包含31

4、個F0、16個F1、224個F2個體進行全基因組掃描,并利用31個無相關個體F0代的基因型分析新微衛(wèi)星位點的特性,結果表明,25個位點純合,113個位點表現(xiàn)為多態(tài),等位基因數(shù)為2-18個,平均為4.65個.113個多態(tài)位點雜合度為0.03-1.0,平均雜合度為0.48;PIC為0.03-0.97,平均PIC為0.46.113個多態(tài)位點遺傳連鎖分析結果顯示,28個未與任何標記連鎖,85個分布在16個連鎖群,平均、雄性及雌性圖譜分別覆蓋11

5、10.7、928.7、1377.2cM;16個連鎖群中,10個雄性圖譜長于雌性圖譜,3個雌性圖譜長于雄性圖譜,2個連鎖群在雄性或雌性圖譜中緊密連鎖,而1個連鎖群在平均、雄性及雌性圖譜中均緊密連鎖,16個連鎖群雄性與雌性圖譜差異為48.29﹪.區(qū)間定位結果表明影響1-7周齡體重的QTL分布在1、4、6、、10及16號連鎖群,顯著或極顯著影響1-7周齡體重的QTL的個數(shù)均為4個;作用于7周齡體尺的QTL分布在2、3、4及14號連鎖群,具有顯