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文檔簡介
1、隱種,是指形態(tài)上幾乎完全相同或尚未發(fā)現(xiàn)差異但遺傳組成上存在顯著分化的物種。隱種很難從形態(tài)學(xué)上加以區(qū)分,有時甚至是不可能區(qū)分,經(jīng)常導(dǎo)致隱種被錯誤的歸于一個物種。分子生物學(xué)技術(shù)的迅猛發(fā)展,為生物學(xué)家們提供了一個研究和探索隱種的新途徑,并為揭示物種遺傳結(jié)構(gòu)、種內(nèi)和種間多樣性提供了有力工具。由于兩棲動物遷移能力弱,種群分化程度高,因而較其他物種包含有更豐富的隱種多樣性。棘胸蛙(Paa spinosa David)是棘蛙屬(Paa)中在我國分布最
2、廣的一種蛙類。前期基于Cytb較短片段序列研究表明,棘胸蛙遺傳結(jié)構(gòu)差異較大,暗示可能存在隱存物種。為了驗證這一假設(shè),本研究擬采用多基因結(jié)合的方法,探討棘胸蛙的系統(tǒng)地理結(jié)構(gòu),以期揭示棘胸蛙的隱種多樣性。具體結(jié)果如下:
本研究測定了中國大陸棘胸蛙及其近緣種的線粒體16S rRNA和12S rRNA基因序列,這些樣品包括:10個地理種群170個棘胸蛙(P.spinosa)樣本、9個九龍棘蛙(P.jiulongensis)樣本、6
3、個棘腹蛙(P.boulengeri)樣本、8個多疣棘蛙(P.verrucospinosa)樣本、13個小棘蛙(P.exilispincsa)樣本和23個棘側(cè)蛙(P.shini)樣本。共獲得的基因序列總長度為1338bp,一共發(fā)現(xiàn)了118個變異位點,分別定義了38個和65個單倍型?;卩徑臃?neighbor joining,NJ)、最大簡約法(Maximum parsimongy,MP)、最大似然法(Maximum likelihood
4、,ML)和最小進(jìn)化法(Maximum evolution,ME)構(gòu)建的單倍型系統(tǒng)發(fā)生樹結(jié)構(gòu)基本一致,結(jié)果表明:來自10個地理種群的棘胸蛙種群基因組成上分為2個單系,即單系A(chǔ)Ⅰ和AⅡ。單系A(chǔ)Ⅰ主要包括浙江麗水、浙江金華、安徽黃山、福建武夷山種群,對應(yīng)于棘胸蛙東部分布區(qū)域;單系A(chǔ)Ⅱ所對應(yīng)的地理種群主要是江西井岡山、湖南平江、廣東陽山、江西廬山、廣西永福、廣西龍勝,在地理分布上為棘胸蛙中部種群。基于系統(tǒng)發(fā)生樹計算棘胸蛙之間的遺傳距離,16S
5、rRNA結(jié)果顯示單系A(chǔ)Ⅰ與小棘蛙的平均遺傳距離為2.863%,單系A(chǔ)Ⅱ與小棘蛙的平均遺傳距離為2.013%,而單系A(chǔ)Ⅰ與AⅡ之間的平均遺傳距離為2.675%,大于單系A(chǔ)Ⅱ與小棘蛙的遺傳距離,達(dá)到了種間以上水平?;?2S rRNA的結(jié)果與16S rRNA保持一致,單系A(chǔ)Ⅰ與小棘蛙的平均遺傳距離為2.845%,單系A(chǔ)Ⅱ與小棘蛙的平均遺傳距離為2.392%,而單系A(chǔ)Ⅰ與AⅡ之間的平均遺傳距離為2.738%,大于單系A(chǔ)Ⅱ與小棘蛙的遺傳距離,達(dá)
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