利用線粒體DNA分子標(biāo)記揭示棘胸蛙中的隱種多樣性.pdf

1、隱種，是指形態(tài)上幾乎完全相同或尚未發(fā)現(xiàn)差異但遺傳組成上存在顯著分化的物種。隱種很難從形態(tài)學(xué)上加以區(qū)分，有時(shí)甚至是不可能區(qū)分，經(jīng)常導(dǎo)致隱種被錯(cuò)誤的歸于一個(gè)物種。分子生物學(xué)技術(shù)的迅猛發(fā)展，為生物學(xué)家們提供了一個(gè)研究和探索隱種的新途徑，并為揭示物種遺傳結(jié)構(gòu)、種內(nèi)和種間多樣性提供了有力工具。由于兩棲動(dòng)物遷移能力弱，種群分化程度高，因而較其他物種包含有更豐富的隱種多樣性。棘胸蛙(Paa spinosa David)是棘蛙屬(Paa)中在我國(guó)分布最

2、廣的一種蛙類。前期基于Cytb較短片段序列研究表明，棘胸蛙遺傳結(jié)構(gòu)差異較大，暗示可能存在隱存物種。為了驗(yàn)證這一假設(shè)，本研究擬采用多基因結(jié)合的方法，探討棘胸蛙的系統(tǒng)地理結(jié)構(gòu)，以期揭示棘胸蛙的隱種多樣性。具體結(jié)果如下:
　　 本研究測(cè)定了中國(guó)大陸棘胸蛙及其近緣種的線粒體16S rRNA和12S rRNA基因序列，這些樣品包括:10個(gè)地理種群170個(gè)棘胸蛙(P.spinosa)樣本、9個(gè)九龍棘蛙(P.jiulongensis)樣本、6

3、個(gè)棘腹蛙(P.boulengeri)樣本、8個(gè)多疣棘蛙(P.verrucospinosa)樣本、13個(gè)小棘蛙(P.exilispincsa)樣本和23個(gè)棘側(cè)蛙(P.shini)樣本。共獲得的基因序列總長(zhǎng)度為1338bp，一共發(fā)現(xiàn)了118個(gè)變異位點(diǎn)，分別定義了38個(gè)和65個(gè)單倍型?；卩徑臃?neighbor joining，NJ)、最大簡(jiǎn)約法(Maximum parsimongy，MP)、最大似然法(Maximum likelihood

4、，ML)和最小進(jìn)化法(Maximum evolution，ME)構(gòu)建的單倍型系統(tǒng)發(fā)生樹結(jié)構(gòu)基本一致，結(jié)果表明:來(lái)自10個(gè)地理種群的棘胸蛙種群基因組成上分為2個(gè)單系，即單系A(chǔ)Ⅰ和AⅡ。單系A(chǔ)Ⅰ主要包括浙江麗水、浙江金華、安徽黃山、福建武夷山種群，對(duì)應(yīng)于棘胸蛙東部分布區(qū)域;單系A(chǔ)Ⅱ所對(duì)應(yīng)的地理種群主要是江西井岡山、湖南平江、廣東陽(yáng)山、江西廬山、廣西永福、廣西龍勝，在地理分布上為棘胸蛙中部種群。基于系統(tǒng)發(fā)生樹計(jì)算棘胸蛙之間的遺傳距離，16S

5、rRNA結(jié)果顯示單系A(chǔ)Ⅰ與小棘蛙的平均遺傳距離為2.863％，單系A(chǔ)Ⅱ與小棘蛙的平均遺傳距離為2.013％，而單系A(chǔ)Ⅰ與AⅡ之間的平均遺傳距離為2.675％，大于單系A(chǔ)Ⅱ與小棘蛙的遺傳距離，達(dá)到了種間以上水平?；?2S rRNA的結(jié)果與16S rRNA保持一致，單系A(chǔ)Ⅰ與小棘蛙的平均遺傳距離為2.845％，單系A(chǔ)Ⅱ與小棘蛙的平均遺傳距離為2.392％，而單系A(chǔ)Ⅰ與AⅡ之間的平均遺傳距離為2.738％，大于單系A(chǔ)Ⅱ與小棘蛙的遺傳距離，達(dá)