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文檔簡(jiǎn)介
1、 本研究從我國(guó)山東省、四川省、海南省、廣東省、福建省、江西省及黑龍江省采集魯西牛(SJ)、渤海黑牛(SW)、宣漢牛(XH)、海南黃牛(HN)、徐聞黃牛(LZ)、閩南牛(MN)、贛南黃牛(T)與延邊牛(YB)共8個(gè)品種的33個(gè)樣品,利用PCR技術(shù),自行設(shè)計(jì)一對(duì)特異性引物,用ClustalW(1.82)軟件對(duì)8個(gè)黃牛品種33個(gè)個(gè)體的線(xiàn)粒體DNAD-loop區(qū)910bp全序列進(jìn)行同源序列比對(duì)與分析,實(shí)驗(yàn)取得如下結(jié)果: 1.檢測(cè)到中國(guó)8
2、個(gè)黃牛品種33個(gè)個(gè)體有21種單倍型;在這21種單倍型D-loop區(qū)全序列中,堿基T平均占28.5﹪,C占24.9﹪,G占13.6﹪,A占33.0﹪。A+T平均含量為61.5﹪,G+C平均含量為38.5﹪,說(shuō)明中國(guó)黃牛D-loop全序列富含A+T堿基。 2.檢測(cè)到21種單倍型有核苷酸多態(tài)位點(diǎn)71個(gè),約占所測(cè)核苷酸總長(zhǎng)的7.80﹪,其中有61個(gè)轉(zhuǎn)換,7個(gè)顛換,3個(gè)轉(zhuǎn)換/顛換共存。 3.中國(guó)8個(gè)黃牛品種mtDNAD-loop區(qū)核苷
3、酸多樣度(π值)為0.00﹪~3.23﹪,單倍型多樣度(H)為0.00~1.00,8個(gè)黃牛群體D-loop的核苷酸多樣度(π值)分2個(gè)層次,海南牛、徐聞牛、贛南牛及延邊牛的核苷酸多樣度(π值)最低,分別為0、0.22﹪、0.15﹪和0.77﹪;閩南牛、渤海黑牛、魯西牛和宣漢牛的苷酸多樣度(π值)很高,別為2.53﹪、2.88﹪、3.03﹪和3.23﹪。表明中國(guó)8個(gè)黃牛品種mtDNA遺傳多樣性比較豐富。 4.根據(jù)單倍型構(gòu)建了中國(guó)8個(gè)
4、黃牛品種的NJ分子系統(tǒng)樹(shù)。聚類(lèi)表明,中國(guó)黃牛有普通牛和瘤牛2大母系起源。延邊牛、渤海黑牛(SW10、SW15)、宣漢牛(XH6、XH9)、魯西牛(SJ8、SJ27),它們與普通牛(ST)聚在一起,說(shuō)明它們起源于普通牛;宣漢牛(XH7)、徐聞牛(LZ16)、魯西牛(SJ5、SJ12、SJ19)、贛南黃牛(T11、T23)、海南牛(HN1)、閩南牛(MN4、MN5),它們與瘤牛(L27732)聚在一起,說(shuō)明它們起源于瘤牛。 5.并探討
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