單跨膜膜蛋白的液體核磁共振結(jié)構(gòu)與動(dòng)力學(xué)研究初探.pdf

1、在此論文中我們主要應(yīng)用液體核磁共振方法研究了膜蛋白KCNE2和Integrinα1跨膜和胞質(zhì)區(qū)的結(jié)構(gòu)與動(dòng)力學(xué)，論文分為五個(gè)部分。
　　 第一章介紹了膜蛋白的背景知識(shí)和膜蛋白結(jié)構(gòu)與功能研究的最新進(jìn)展，以及應(yīng)用核磁共振研究膜蛋白結(jié)構(gòu)與功能的現(xiàn)狀，特別是小膜蛋白研究的現(xiàn)狀、機(jī)遇與挑戰(zhàn)。第二章介紹了核磁共振的一些基本理論和應(yīng)用于蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)研究的技術(shù)和方法。
　　 第三章我們應(yīng)用跨膜螺旋預(yù)測(cè)(TMHMM)軟件和信號(hào)肽預(yù)測(cè)（Sign

2、alP）軟件對(duì)兩個(gè)數(shù)據(jù)庫NCBI和Uniprot的人源蛋白進(jìn)行了跨膜螺旋預(yù)測(cè)和統(tǒng)計(jì)分析。我們統(tǒng)計(jì)分析了跨膜螺旋的數(shù)量、長度、蛋白分子量和功能分類以及氨基酸類型的分布。
　　 第四章簡要介紹了調(diào)控心臟動(dòng)作電位的鉀離子通道，以及調(diào)控心肌細(xì)胞復(fù)極化的一對(duì)電壓門控鉀離子通道（延遲整流通道）Ikr(MiRP1/HERG)和Iks(MinK/KCNQ1)以及調(diào)控它們通道活性的β亞基KCNE家族蛋白的情況。我們表達(dá)和純化了KCNE2蛋白，并篩

3、選合適的去污劑來研究它的液體核磁共振結(jié)構(gòu)特性。結(jié)果和KCNE1的研究相似，LMPG是最適合的去污劑。然后應(yīng)用核磁共振技術(shù)解析了它的三維結(jié)構(gòu)并進(jìn)行了主鏈動(dòng)力學(xué)分析。通過和KCNE1結(jié)構(gòu)的比較，發(fā)現(xiàn)它們?cè)诮Y(jié)構(gòu)上存在較大的差別。主鏈動(dòng)力學(xué)數(shù)據(jù)與結(jié)構(gòu)分析的結(jié)果也是一致的。
　　 第五章介紹了整合素蛋白家族在細(xì)胞粘附中的功能以及整合素蛋白目前的結(jié)構(gòu)研究現(xiàn)狀。其跨膜和胞質(zhì)區(qū)的結(jié)構(gòu)研究主要是集中在αⅡbβ3的跨膜區(qū)或者胞質(zhì)區(qū)的核磁共振結(jié)構(gòu)研究