版權(quán)說(shuō)明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請(qǐng)進(jìn)行舉報(bào)或認(rèn)領(lǐng)
文檔簡(jiǎn)介
1、背景:環(huán)狀RNA(circRNA)是一類閉合環(huán)狀結(jié)構(gòu)的非編碼RNA,不易受到RNA核酸外切酶或RNase R酶的降解,較mRNA能更穩(wěn)定的存在于外周循環(huán)血中,正成為非侵入分子診斷研究的熱點(diǎn)。同時(shí)也正由于這種環(huán)狀結(jié)構(gòu),造成了逆轉(zhuǎn)錄過(guò)程中的“滾環(huán)現(xiàn)象”和對(duì)下一步qPCR定量檢測(cè)方法的影響。
微滴數(shù)字PCR(droplet digital PCR:ddPCR)是一種基于終點(diǎn)分析陽(yáng)性反應(yīng)微滴數(shù)和陰性反應(yīng)微滴數(shù)的絕對(duì)定量檢測(cè)方法,而不依
2、賴于反應(yīng)過(guò)程中熒光信號(hào)強(qiáng)度的具體變化率,因此ddPCR可望克服這一技術(shù)難題,提高對(duì)循環(huán)血中痕量的游離環(huán)狀RNA定量檢測(cè)的準(zhǔn)確性。另一方面,環(huán)狀RNA在循環(huán)血中的穩(wěn)定性,和樣品處理過(guò)程對(duì)環(huán)狀RNA定量檢測(cè)數(shù)據(jù)變異度的影響,是影響環(huán)狀RNA作為非侵入性分子診斷研究的前提。
目的:本研究首先探討環(huán)狀RNA反轉(zhuǎn)錄過(guò)程中存在的“滾環(huán)現(xiàn)象”對(duì)qPCR定量檢測(cè)的影響,并通過(guò)對(duì)比RT-qPCR和RT-ddPCR兩種不同檢測(cè)方法對(duì)環(huán)狀RNA表達(dá)
3、水平定量檢測(cè)的結(jié)果,擬評(píng)估ddPCR用于定量檢測(cè)環(huán)狀RNA的有效性。最后本研究運(yùn)用ddPCR檢測(cè)了循環(huán)血中游離環(huán)狀RNA的穩(wěn)定性和樣本處理過(guò)程對(duì)環(huán)狀RNA濃度的影響,評(píng)估環(huán)狀RNA作為分子標(biāo)志物的可行性。
方法:實(shí)驗(yàn)一、環(huán)狀RNA逆轉(zhuǎn)錄(RT)過(guò)程中的“滾環(huán)現(xiàn)象”對(duì)RT-qPCR定量檢測(cè)結(jié)果的影響:(1)抽取外周靜脈血,提取總RNA,與RT反應(yīng)物混合后,平均分為5等分;(2)分別給予15min(分鐘),30min,60min,
4、90min,和120min的逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng),獲得不同的cDNA產(chǎn)物,進(jìn)一步行PCR反應(yīng),qPCR和ddPCR反應(yīng);(3)對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳觀察條帶,并比較qPCR和ddPCR對(duì)相同cDNA的定量結(jié)果。
實(shí)驗(yàn)二、環(huán)狀RNA在血清和血漿中的穩(wěn)定性:(1)抽取外周靜脈血于血清管和EDTA抗凝管,然后分為2組;(2)組1的血清管和EDTA抗凝管樣本,立即給予2步離心法,分別獲得血清和血漿,然后分離了的血清和血漿于室溫保存預(yù)設(shè)的
5、時(shí)間點(diǎn)后,提取RNA,進(jìn)行RT-ddPCR反應(yīng)。組2的血清管和EDTA抗凝管樣本,先予室溫保存預(yù)設(shè)的時(shí)間點(diǎn)后,再給予2步離心法,分別獲得血清和血漿,并提出RNA,進(jìn)行RT-ddPCR反應(yīng);(3)對(duì)結(jié)果進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。
結(jié)果:(1)環(huán)狀RNA的RT-PCR反應(yīng)可產(chǎn)生多條帶產(chǎn)物,隨RT反應(yīng)時(shí)間的延長(zhǎng),長(zhǎng)條帶產(chǎn)物增加,表明環(huán)狀RNA特殊的閉合環(huán)狀結(jié)構(gòu)使其在逆轉(zhuǎn)錄過(guò)程中產(chǎn)生“滾環(huán)現(xiàn)象”,可生成包含外顯子串聯(lián)體的長(zhǎng)單鏈cDNA。(2)隨著
6、RT反應(yīng)時(shí)間的延長(zhǎng),qPCR對(duì)環(huán)狀RNA的定量結(jié)果增加,而ddPCR對(duì)環(huán)狀RNA的定量結(jié)果保持不變。(3)環(huán)狀RNA在及時(shí)分離的血清/血漿樣本可穩(wěn)定存在達(dá)24小時(shí)。(4)6小時(shí)內(nèi)分離血細(xì)胞,不影響環(huán)狀RNA在血清/血漿中的濃度。(5)環(huán)狀RNA在延遲24小時(shí)分離血細(xì)胞的血清/血漿中濃度下降。
結(jié)論:ddPCR不受逆轉(zhuǎn)錄過(guò)程中“滾環(huán)現(xiàn)象”產(chǎn)生的長(zhǎng)單鏈cDNA的干擾,較qPCR能更準(zhǔn)確地用于環(huán)狀RNA的定量檢測(cè)。環(huán)狀RNA可在人血
溫馨提示
- 1. 本站所有資源如無(wú)特殊說(shuō)明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請(qǐng)下載最新的WinRAR軟件解壓。
- 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請(qǐng)聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
- 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁(yè)內(nèi)容里面會(huì)有圖紙預(yù)覽,若沒(méi)有圖紙預(yù)覽就沒(méi)有圖紙。
- 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
- 5. 眾賞文庫(kù)僅提供信息存儲(chǔ)空間,僅對(duì)用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護(hù)處理,對(duì)用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對(duì)任何下載內(nèi)容負(fù)責(zé)。
- 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當(dāng)內(nèi)容,請(qǐng)與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
- 7. 本站不保證下載資源的準(zhǔn)確性、安全性和完整性, 同時(shí)也不承擔(dān)用戶因使用這些下載資源對(duì)自己和他人造成任何形式的傷害或損失。
最新文檔
- SnAgCu微納液滴的凝固組織及熱穩(wěn)定性研究.pdf
- 線蟲和水稻中環(huán)狀RNA的預(yù)測(cè)分析.pdf
- 人類和小鼠中環(huán)狀RNA鑒定及分析.pdf
- 柑橘潰瘍病微滴數(shù)字PCR與定量PCR檢測(cè)方法的比較研究.pdf
- 凍融循環(huán)作用對(duì)土體邊坡穩(wěn)定性的影響研究.pdf
- 環(huán)狀神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型的穩(wěn)定性與分岔分析.pdf
- 循環(huán)經(jīng)濟(jì)產(chǎn)業(yè)鏈穩(wěn)定性研究.pdf
- 基于數(shù)字技術(shù)的硅微陀螺儀性能穩(wěn)定性研究.pdf
- 基于bishope法在深基坑穩(wěn)定性的應(yīng)用
- 17704.基于plateaurayleigh不穩(wěn)定性的微液滴生成方法及應(yīng)用研究
- 儲(chǔ)能系統(tǒng)對(duì)交流微電網(wǎng)穩(wěn)定性的作用研究.pdf
- 母液循環(huán)法合成高穩(wěn)定性介孔分子篩的研究.pdf
- 農(nóng)藥微乳劑穩(wěn)定性機(jī)理研究.pdf
- 多時(shí)滯環(huán)狀神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的穩(wěn)定性與分岔分析.pdf
- 圍巖穩(wěn)定性分級(jí)的改進(jìn)可拓法應(yīng)用研究.pdf
- 旋轉(zhuǎn)對(duì)稱環(huán)狀結(jié)構(gòu)模態(tài)特性及穩(wěn)定性預(yù)測(cè).pdf
- 19084.靜磁場(chǎng)對(duì)電磁懸浮液滴穩(wěn)定性影響的研究
- 鋁業(yè)循環(huán)經(jīng)濟(jì)系統(tǒng)穩(wěn)定性研究.pdf
- 區(qū)域循環(huán)經(jīng)濟(jì)模式及穩(wěn)定性研究.pdf
- RPA技術(shù)與微滴數(shù)字PCR在轉(zhuǎn)基因玉米與大豆檢測(cè)中的應(yīng)用.pdf
評(píng)論
0/150
提交評(píng)論