基于DTW距離的生物序列相似性分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、隨著人類基因組測序計(jì)劃的完成，生物學(xué)研究的重點(diǎn)正從積累數(shù)據(jù)向分析解釋這些數(shù)據(jù)過渡，生物信息學(xué)即計(jì)算分子生物學(xué)便應(yīng)運(yùn)而生。生物序列比較是計(jì)算分子生物學(xué)的主要研究內(nèi)容之一，序列比較的主要目的是通過分析序列之間的相似性闡明序列之間的同源關(guān)系、尋找序列的編碼片段以及從已知序列預(yù)測新序列的結(jié)構(gòu)和功能。本文以生物序列的比較分析為背景，提出了新的相似度量，為生物序列的分類、分析和比較等研究提供新的方法。另外，還列舉了新的相似度量在生物序列的相似性分析

2、問題中的具體應(yīng)用。本文研究內(nèi)容可以概括如下：
　　 1.在第二章，提出一種基于DTW(動態(tài)時間彎曲)距離的DNA序列相似性度量方法。根據(jù)復(fù)平面上DNA序列的圖形表示及復(fù)向量的主要特征—模和相位，把DNA序列轉(zhuǎn)化為模序列，計(jì)算其DTW距離來度量序列相似度以表征DNA序列屬性，并用這個方法比較分析七種東亞鉗蝎神經(jīng)毒素基因序列的相似性，驗(yàn)證了該度量方法的有效性和準(zhǔn)確性。
　　 2.在第三章，根據(jù)DNA序列的一種三維空間表示，得

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