細首科紐蟲分子系統(tǒng)發(fā)育及三種紐蟲線粒體基因組的研究.pdf

1、細首科(Cephalothricidae)隸屬紐形動物門古紐目(Palaeonemertea)。由于其有限的形態(tài)學(xué)特征及形態(tài)學(xué)鑒定本身的復(fù)雜性，而成為分類學(xué)中較為混亂的類群之一。有關(guān)線細首科系統(tǒng)發(fā)育的研究較少，尤其從分子水平上來研究線細首科紐蟲系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系目前還未見報道。本研究將以細首科紐蟲為研究對象，驗證統(tǒng)計簡約網(wǎng)絡(luò)法進行物種界定的可行性；擬基于COI，16SrDNA，28SrDNA基因序列探討細首科紐蟲的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系，并且利用三種紐

2、蟲線粒體基因組基因排列信息及蛋白質(zhì)編碼基因，探討紐蟲在后生動物中的分類地位。主要研究成果如下： 1．擴增了線細首科165個個體的線粒體COI基因，依據(jù)統(tǒng)計簡約法原理，用TCS軟件構(gòu)建單倍型網(wǎng)絡(luò)圖。探討此方法在線細首科紐蟲中進行物種界定的可行性。同時在MEGA4.0軟件中進行遺傳距離分析，在Phyml和MrBayes軟件中構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。結(jié)果表明，同一種的個體明顯地聚在同一個單倍型網(wǎng)絡(luò)圖中。種間K2p遺傳距離顯著地大于種內(nèi)遺傳距離

3、，得到的最大似然樹和貝葉斯樹顯示同一物種的不同個體均形成高支持率的單系。因此得出結(jié)論，基于線粒體COI基因的統(tǒng)計簡約單倍型網(wǎng)絡(luò)圖方法能夠?qū)毷卓莆锓N進行有效地物種界定。 2．以核基因(28SrDNA)和線粒體基因(16SrDNA和COI)為遺傳標記，對線細首科的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系進行了探討。以針紐目Amphiporus angulatus，Amphiporuslactifloreus為外類群，采用最大似然法(ML)和貝葉斯法(BI)分

4、別構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。系統(tǒng)發(fā)育樹的拓撲結(jié)構(gòu)顯示，細首科并不是單系。 3．首次測定了紐形動物門三種紐蟲，Cephalothrix simula，Cephalothrix sp．和Paranemetes peregrine的線粒體基因組，基因組大小分別為16296bp，15800 bp(部分非編碼區(qū)沒有測定)和14560bp。三者均包含后生動物線粒體基因組典型的基因組成(13個蛋白質(zhì)編碼基因、22個轉(zhuǎn)運RNA和2個核糖體RNA)。C．

5、simula與C． sp．基因排列完全一致。與這兩種紐蟲相比，Paranemetesperegrine的基因組中有11個基因發(fā)生了易位包括4個蛋白質(zhì)編碼基因(nad6，cox1，cox2，atp6)和7個tRNA(trnY trnE trnG，trnF，trnQ，trnW，trnC)。 基于基因排列，蛋白質(zhì)編碼基因氨基酸及氨基酸數(shù)據(jù)的系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果均支持紐蟲與有體腔的冠輪動物有較近的親緣關(guān)系，而不是無體腔的扁形動物?；诨蚺?/p>