北方須鰍線粒體基因組序列測定及鰍科魚類系統(tǒng)發(fā)育分析.pdf

1、線粒體是真核生物所不可或缺的雙層膜結(jié)構(gòu)的細(xì)胞器，動(dòng)物線粒體DNA(mitochondrialDNA)具有進(jìn)化速度快，嚴(yán)格母系遺傳，不存在基因重組等特征，因此是基因功能研究和物種遺傳進(jìn)化研究的好材料。
　　北方須鰍（Barbatulatoni）隸屬于鯉形目、鰍科、條鰍亞科、須鰍屬，本研究通過參考北方須鰍的近緣物種須鰍的線粒體基因組全序列，共計(jì)設(shè)計(jì)了26對(duì)引物，采用溫度梯度PCR技術(shù)擴(kuò)增出了北方須鰍線粒體基因組的全序列，然后運(yùn)用相關(guān)軟

2、件對(duì)其進(jìn)行分析研究，結(jié)合NCBI中已公布的鰍科魚類的線粒體基因組信息，構(gòu)建鰍科魚類系統(tǒng)發(fā)育樹，研究結(jié)論如下:
　　1.北方須鰍線粒體基因組全長16619bp，其中4721個(gè)堿基A，占28.4％，2978個(gè)堿基G，占17.9％，4399個(gè)堿基T，占26.5％，4521個(gè)堿基C，占27.2％，A+T含量為54.9％，明顯大于G+C含量，其中D-loop區(qū)A+T的含量最高，達(dá)到67.3％。
　　2.北方須鰍線粒體基因組總共編碼37

3、個(gè)基因，即13個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因(PCGs)，2個(gè)rRNA基因，22個(gè)tRNA基因與1個(gè)控制區(qū)序列。其中Gln、Pro、Ala、Cys、Asn、Glu、Tyr、SerUCN8個(gè)tRNA基因和蛋白質(zhì)編碼基因ND6共9個(gè)基因由L鏈編碼，其余28個(gè)基因則是由H鏈編碼。
　　3.北方須鰍蛋白質(zhì)編碼基因中COⅠ的起始密碼子是GTG，另外12個(gè)編碼基因則是以ATG行使其功能，北方須鰍的終止密碼子使用方面，把TAA作為終止密碼子的有ND1、COⅠ

4、、ATP8、ATP6、ND4L、ND5、ND6共7個(gè)基因，把TAG作為終止密碼子的有ND2、ND3共2個(gè)基因，以T作為終止密碼子的有COⅡ、COⅢ、Cytb共3個(gè)基因，以TA作為終止密碼子的有ND4。
　　4.北方須鰍線粒體基因組編碼22個(gè)tRNA基因，共1557bp，軟件預(yù)測tRNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)，可以看出其二級(jí)結(jié)構(gòu)為典型的三葉草構(gòu)型。12SrRNA基因位于tRNA基因Phe和Val之間，長度950bp，16SrRNA基因位于tRN