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文檔簡(jiǎn)介
1、目的:通過(guò)基因芯片技術(shù)獲得兒童過(guò)敏性紫癜中的差異miRNAs表達(dá)譜,生物信息學(xué)分析關(guān)鍵miRNAs分子調(diào)控的靶基因及信號(hào)通路,闡明miRNA在兒童過(guò)敏性紫癜中發(fā)生發(fā)展中的作用。
方法:收集10例兒童過(guò)敏性紫癜病人和10例正常健康兒童的血漿標(biāo)本,提取總RNA;采用基因芯片技術(shù)檢測(cè)兒童過(guò)敏性紫癜病人和正常健康兒童血漿中的差異miRNAs;運(yùn)用qRT-PCR技術(shù)檢測(cè)兩個(gè)差異miRNAs:miR-122和miR-149的表達(dá)水平;并通
2、過(guò)生物信息學(xué)分方法分析miR-122和miR-149調(diào)控的靶基因及相關(guān)信號(hào)通路。
結(jié)果:
1.獲得兒童過(guò)敏性紫癜病人和正常健康兒童血漿的差異 miRNAs表達(dá)譜;兒童過(guò)敏性紫癜血清中,上調(diào)的miRNAs有16個(gè),下調(diào)的miRNAs有12個(gè)。
2.兒童過(guò)敏性紫癜病人中,上調(diào)倍數(shù)最大的為miR-122,上調(diào)15.3413倍;下調(diào)倍數(shù)最大的為miR-149,下調(diào)-5.1245倍。
3.10例兒童過(guò)敏性紫
3、癜病人中,miR-122的平均值為172.8±7.2,10例正常健康兒童中, miR-122的平均值為31.2±5.5,上調(diào)倍數(shù)為5.5倍;10例兒童過(guò)敏性紫癜病人中,miR-149的平均值為18.4±1.6,10例正常健康兒童中,miR-149的平均值為65.7±3.5,下調(diào)倍數(shù)為-3.6倍,基因芯片和qRT-PCR驗(yàn)證結(jié)果一致。
4. miR-122調(diào)控的靶基因有173個(gè),miR-149調(diào)控的靶基因有445個(gè)。
4、5.173個(gè)miR-122調(diào)控的靶基因涉及的信號(hào)通路主要包括:Dicer、MAPK、FAS、AKT、ErbB、p53等6條信號(hào)通路;445個(gè)miR-149調(diào)控的靶基因涉及的的功能聚類主要包括:Cell cycle、Wnt、TGF-beta、p53、MAPK、Calcium、Apoptosis、AKT、Ras等10條信號(hào)通路。
結(jié)論:
1.通過(guò)基因芯片方法獲得了兒童過(guò)敏性紫癜病人和正常健康兒童血漿的差異 miRNAs表
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