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文檔簡介
1、目的:探討HOXA7和NEK2及BMI-1蛋白表達(dá)和mRNA改變與口腔鱗狀細(xì)胞癌中的發(fā)生及臨床特征的關(guān)系,為臨床口腔鱗狀細(xì)胞癌的防治提供新的理論與治療靶點(diǎn)。
方法:
1.利用基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(Gene Expression Omnibus,GEO)基因芯片GSE3524,使用R語言軟件(R3.2.3)篩選差異基因(差異倍數(shù)≥2,P<0.01),利用STRING online工具篩選OSCC組織T4分期相對T2分期的上調(diào)
2、差異基因(可信度≥0.4),篩選結(jié)果輸入Cytoscape軟件構(gòu)建蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)圖(Protein-Protein interaction network,PPI),利用ClusterONE對上調(diào)差異基因進(jìn)行相互作用聚類分析,篩選核心功能差異基因,再次利用STRING online工具預(yù)測可能的上下游關(guān)系及信號(hào)通路。
2.收集口腔鱗狀細(xì)胞癌組織標(biāo)本60例,正??谇火つそM織60例為對照組,應(yīng)用免疫組織化學(xué)檢測HOXA7和NE
3、K2及BMI-1蛋白在鱗狀細(xì)胞癌組織中表達(dá),應(yīng)用Real Time-qPCR檢測HOXA7和NEK2及BMI-1 mRNA表達(dá),分析HOXA7和NEK2及BMI-1表達(dá)與口腔鱗狀細(xì)胞癌患者臨床特征之間的關(guān)系。通過Spearman等級(jí)相關(guān)分析和STRING在線分析工具,比較三種基因的相關(guān)性,探究其在口腔鱗狀細(xì)胞癌致癌機(jī)制中的相關(guān)性。
結(jié)果:
1.通過生物信息學(xué)的分析預(yù)測,發(fā)現(xiàn)HOXA7,NEK2,BMI-1基因與MAP
4、K1、MYC等基因間可能存在復(fù)雜的相互作用信號(hào)通路。
2.口腔鱗狀細(xì)胞癌中HOXA7、NEK2及BMI-1蛋白表達(dá)明顯高于正常對照組的(P<0.05)。HOXA7、NEK2及BMI-1蛋白表達(dá)與患者性別(P>0.05)和年齡(P>0.05)無關(guān)。在中分化和低分化鱗狀細(xì)胞癌組(n=16)中HOXA7、NEK2及BMI-1蛋白表達(dá)明顯高于高分化組(P<0.05)。Ⅰ期和Ⅱ期患者(n=38)中HOXA7、NEK2及BMI-1蛋白表達(dá)
5、明顯低于Ⅲ期和Ⅳ期患者(n=22)(P<0.05);Real Time-qPCR檢測HOXA7、NEK2及BMI-1 mRNA表達(dá)在口腔鱗狀細(xì)胞癌中明顯高于正常對照組(P<0.05)。HOXA7、NEK2及BMI-1mRNA表達(dá)與患者性別(P>0.05)和年齡(P>0.05)無關(guān)。在中分化和低分化鱗狀細(xì)胞癌組(n=16)中HOXA7、NEK2及BMI-1mRNA表達(dá)明顯高于高分化組(n=44)(P<0.05)。Ⅰ期和Ⅱ期患者(n=38)
6、中HOXA7、NEK2及BMI-1mRNA表達(dá)明顯低于Ⅲ期和Ⅳ期患者(n=22)的(P<0.05);同時(shí)結(jié)果經(jīng)相關(guān)分析后發(fā)現(xiàn)腫瘤組織中HOXA7、NEK2和BMI-1蛋白表達(dá)呈正相關(guān)關(guān)系(P<0.05)。
結(jié)論:
1.HOXA7,NEK2和BMI-1之間具有協(xié)同作用,可能導(dǎo)致OSCC腫瘤分化差和更晚的臨床分期。
2.HOXA7,NEK2和BMI-1可能參與口腔鱗狀細(xì)胞癌的發(fā)生和發(fā)展,為臨床防治提供新的理論指
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