基于智能算法的蛋白質折疊研究.pdf

1、研究蛋白質的折疊是生命科學領域的前沿課題之一。蛋白質是一種生物大分子，是由20種氨基酸以肽鍵連接成肽鏈，在空間卷曲折疊成為特定的三維空間結構。因為蛋白質只有在特定的三維空間結構下才能發(fā)揮其各種與生命活動息息相關的生物功能，因此了解蛋白質的三維結構并進一步了解如何形成特定的三級結構成為了研究熱點，也就是所謂的蛋白質折疊問題?；谶@個問題，主要在以下幾個方面進行研究： 首先，分析蛋白質折疊模型和能量優(yōu)化函數(shù)，得出蛋白質非格點模型和

2、簡化能量函數(shù)在蛋白質折疊研究中的必要性，并設計實現(xiàn)基于非格點模型的蛋白質折疊的能量計算模塊。其次，由于智能算法具有魯棒性和較好的尋優(yōu)能力的特點，因而研究遺傳算法、蟻群算法和粒子群三種智能算法并將它們應用蛋白質折疊研究。再次，將近年來新提出的人工魚群算法應用于蛋白質折疊的模擬并進行重點研究。對折疊結果進行相應的分析，結果表明人工魚群算法在蛋白質折疊過程具有較好的全局尋優(yōu)能力，更容易找到最優(yōu)解。最后，為了實現(xiàn)蛋白質折疊過程的可視化，以虛擬現(xiàn)