基于SVM的蛋白質(zhì)折疊子識別研究.pdf

1、本文基于計算機技術(shù)和生物學原理，以蛋白質(zhì)序列中蘊含的生物信息分類為依據(jù)，對蛋白質(zhì)中α類、β類、α+β類及α/β類中樣本數(shù)量較多的27類折疊子類型進行識別研究，提出了一種基于統(tǒng)計量“矩”的特征向量表示法，并進一步構(gòu)建IDAG-SVM多分類器進行識別，其主要研究為以下幾方面： 第一，提出了矩描述子特征向量表示法。在研究了Dubchak特征向量表示法的基礎(chǔ)上，利用統(tǒng)計學中的“矩”來描述氨基酸殘基的順序和位置信息，構(gòu)建了矩描述子特征向量

2、集?！熬亍钡囊?，克服了Dubchak不能描述蛋白質(zhì)氨基酸序列的順序和耦合信息的缺點，使得新特征向量表示法能夠有效的描述氨基酸組成、順序和耦合信息等重要蛋白質(zhì)序列特征。 第二，設(shè)計了IDAG-SVM多分類器。對常見支持向量機多類分類算法(“一對多”、“一對一”和有向無環(huán)圖DAG)的原理和優(yōu)缺點進行研究和分析。在此基礎(chǔ)上，引入了一種以類樣本分布情況生成有向無環(huán)圖思想，提出改進的有向無環(huán)圖多分類算法(IDAG)，用于蛋白質(zhì)折疊子識別