基于Web Services的蛋白質相互作用網絡PSE研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、近幾十年來，問題求解環(huán)境(PSE，ProblemSolvingEnvironment)一直是人們研究的熱點之一。隨著人類基因組測序工作的初步完成，生物信息學這一新興交叉學科得以產生和發(fā)展，并成為生物學，計算機科學以及應用數(shù)學等多種學科研究的熱點。然而，隨著傳統(tǒng)生物實驗數(shù)據(jù)的快速增長和與蛋白質相互作用網絡相關的算法層出不窮，如何高效共享大量的數(shù)據(jù)和方便的利用各種工具及方法，成為蛋白質相互作用網絡研究人員面臨的難題。而蛋白質相互作用網絡PS

2、E就成為解決這類問題的非常有效的方法，結合蛋白質相互作用網絡的具體需求，本文建立了基于WebServices的蛋白質相互作用網絡PSE實驗系統(tǒng)。 本論文的創(chuàng)新工作主要為以下內容： 在充分了解蛋白質相互作用網絡的特點及需求，同時結合PSE的特點，本文建立了基于WebServices的蛋白質相互作用網絡PSE。這是目前國內建立較早的蛋白質相互作用網絡PSE?；赪ebServices的蛋白質相互作用網絡PSE為實現(xiàn)資源共

3、享，協(xié)同工作，并提供了易用的高性能計算環(huán)境。這樣就有效解決了用傳統(tǒng)方法研究蛋白質相互作用網絡時遇到的問題。 本文以蛋白質相互作用網絡PSE為研究對象，詳細闡述了生物信息學、蛋白質相互作用網絡、網格技術及PSE的概念、國內外現(xiàn)狀及意義。給出了基于WebServices的蛋白質相互作用網絡PSE體系結構、各部分功能等，同時也詳細訴述了在構建基于WebServices的蛋白質相互作用網絡PSE時所用到的關鍵技術，包括數(shù)據(jù)壓縮技術、負

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