基于序列的蛋白質-藥物相互作用預測研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、蛋白質是生命科學和醫(yī)藥化學中一類重要的有機大分子，蛋白質擔負著各種生理功能，是生命活動的重要承擔者。因此研究蛋白質與藥物之間相互作用機制，對于促進人類健康具有十分重要的意義。
　　蛋白質(Protein)與藥物(Drug)相互作用的識別在研究基因組藥物過程中起著關鍵的作用。傳統(tǒng)的生物實驗方法確定蛋白質與藥物相互作用，從時間和費用兩個方面來說代價都是昂貴的。因此，利用模式識別技術，直接從蛋白質序列出發(fā)預測蛋白質與藥物相互作用就成了一

2、項重要的工作。
　　本文提出了一種基于序列的蛋白質-藥物相互作用預測方法:從蛋白質序列出發(fā)提取了進化信息PSSM_ACT特征和偽氨基酸組成(PseAAC)特征，從藥物分子結構出發(fā)提取了分子指紋特征，并對分子指紋特征分別進行了離散傅里葉變換和離散小波變換，然后通過特征組合方法將蛋白質特征和藥物特征組合為不同蛋白質-藥物對向量作為訓練樣本。在預測階段，采用基于證據(jù)理論K近鄰、支持向量機(SVM)和隨機森林(RandomForest)計

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