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文檔簡介
1、本文從蛋白質(zhì)一級序列出發(fā)，采用支持向量機及多分類器組合算法對蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用位點進行分類研究，主要工作如下： (1)構(gòu)建包含四種不同類型的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用位點數(shù)據(jù)庫，數(shù)據(jù)庫由133條蛋白質(zhì)序列組成。 (2)采用兩種接觸面殘基定義方法，將蛋白質(zhì)序列中的殘基標定為接觸面殘基和非接觸面殘基兩類樣本?；谛蛄休喞畔⑻崛》?，從蛋白質(zhì)序列中提取殘基的多種序列輪廓，組成大小不等的殘基信息窗，使用支持向量機對其進行分類預(yù)測
2、、比較和分析，結(jié)果表明： 1)兩種接觸面殘基定義方法下，包含多個相鄰殘基的信息窗所得分類精度較單個殘基的信息窗均有不同程度的提高，以包含7個相鄰殘基的信息窗效果最好。 2)并不是相鄰氨基酸越多，支持向量機對殘基信息窗的分類精度就越高，相鄰殘基之間存在一定的信息融合問題，當二者之間存在矛盾或不協(xié)調(diào)時，分類結(jié)果將降低；當二者信息互補時，分類結(jié)果將提高。 (3)提出將多分類器組合算法應(yīng)用于蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用位點預(yù)測
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