不同氮、磷濃度條件下銅綠微囊藻(Microcystis aeruginosa)差異蛋白質(zhì)組學(xué)的研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、銅綠微囊藻(Microcystisaeruginosa)是富營養(yǎng)化湖泊和水庫中形成“水華”的主要藍(lán)藻。分子生物學(xué)技術(shù)和蛋白質(zhì)組學(xué)的快速發(fā)展為深入研究赤潮形成及其性質(zhì)提供了重要手段。赤潮對人類正常生活和環(huán)境的影響日益嚴(yán)重,由于赤潮發(fā)生是多方面原因引起的,研究常見赤潮藻種在特定環(huán)境中的蛋白質(zhì)組差異,從中尋找出有價值的蛋白質(zhì)分子水平上的差異,這對一些赤潮的防治和治理具有重要意義。 本文運用蛋白質(zhì)組學(xué)及生物信息學(xué)技術(shù)方法,研究銅綠微囊藻

2、全蛋白分別在不同濃度氮/磷營養(yǎng)鹽條件下變化的情況,并模擬自然界正常條件下及富營養(yǎng)化環(huán)境比較研究銅綠微囊藻耐受氮/磷環(huán)境中蛋白表達(dá)的差異,以及差異蛋白在生物代謝途徑中起作用的機(jī)制,旨在研究在富營養(yǎng)化環(huán)境中蛋白表達(dá)的差異。 首先,我們比較了銅綠微囊藻全蛋白的三種提取方法,利用雙向電泳技術(shù)篩選出最適的方法,即超聲破碎與TCA-丙酮結(jié)合法,并運用于幾種藍(lán)藻,結(jié)果表明這種方法適用于多數(shù)藍(lán)藻蛋白的提取。進(jìn)一步地,我們采取優(yōu)化的蛋白提取方法,

3、穩(wěn)定的雙向電泳條件及高靈敏度的質(zhì)譜分析,構(gòu)建了銅綠微囊藻蛋白的分子解剖圖譜。隨機(jī)選取的110個蛋白質(zhì)點的質(zhì)譜結(jié)果中21個確定為數(shù)據(jù)庫中收錄的藍(lán)藻的基因或蛋白,其中只有10個為數(shù)據(jù)庫中收錄的聚球藻Synechococcussp.PCC6803或微囊藻的基因或蛋白,其比例約為1∶11,這些結(jié)果對銅綠微囊藻的蛋白分析和有關(guān)功能基因組的研究具有較高的參考價值。 接著,我們探討了氮元素對銅綠微囊藻生長和蛋白表達(dá)的影響,以BG-11為基礎(chǔ)培

4、養(yǎng)基,調(diào)整氮元素的濃度(1.6mg/L,16.3mg/L,245.1mg/L,490.2mg/L),于無菌條件下對藻株進(jìn)行誘導(dǎo)。雙向電泳分離和質(zhì)譜鑒定結(jié)果表明,低氮濃度時(1.6mg/L),6個蛋白點表達(dá)量降低,1個表達(dá)量增高;高氮濃度時(490.2mg/L),1個蛋白點表達(dá)量降低,3個表達(dá)量增高。各濃度下共有32個表達(dá)差異的蛋白,其中DinitrogenasereductaseADP-ribosyltransferase(DRAT)蛋

5、白的功能與氮代謝有關(guān)。 進(jìn)一步地,我們模擬了自然界中正常的環(huán)境和富營養(yǎng)化的環(huán)境,研究赤潮爆發(fā)時銅綠微囊藻蛋白表達(dá)的差異。雙向電泳分離和質(zhì)譜鑒定的結(jié)果表明,2個蛋白點只在富營養(yǎng)化條件下表達(dá),3個蛋白點只在自然條件下表達(dá),1個蛋白點富營養(yǎng)條件下表達(dá)量較自然條件低,其中2個蛋白的功能與氮代謝有關(guān)。 本文確定了提取銅綠微囊藻蛋白的最適方法,并首次運用于多數(shù)藍(lán)藻蛋白的提取并取得準(zhǔn)確、可靠的結(jié)果。首次采用蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),研究銅綠微囊

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