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文檔簡介
1、目的:1.運(yùn)用生物信息學(xué)的方法對細(xì)粒棘球蚴延伸因子-1和磷酸丙糖異構(gòu)酶T、B細(xì)胞表位以及各級結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測,獲得可取的抗原表位,對兩者的免疫診斷性初步分析,了解其診斷價(jià)值。2.利用原核表達(dá)技術(shù),通過對上述兩種基因構(gòu)建表達(dá)載體,獲得重組蛋白,為后期免疫保護(hù)和診斷價(jià)值等研究奠定基礎(chǔ)。
方法:1.經(jīng)Expasy系統(tǒng)預(yù)測兩種基因的理化性質(zhì),使用DNAStar軟件來分析蛋白親水性、柔性區(qū)域、抗原指數(shù)及表面可及性,利用 ABCpred與 I
2、EDB軟件綜合預(yù)測B細(xì)胞線性抗原表位,通過DNAStar軟件預(yù)測T細(xì)胞表位,使用SOPMA軟件預(yù)測二級結(jié)構(gòu),SWISS-MODEL網(wǎng)站構(gòu)建三維結(jié)構(gòu)。使用 DNAstar軟件對Eg和人類EF-1、TPI的氨基酸序列進(jìn)行比對。2.通過RT-PCR獲得目的基因與克隆載體連接形成重組質(zhì)粒,重組質(zhì)粒與pET-28α(+)經(jīng)雙酶切連接成原核表達(dá)重組質(zhì)粒,表達(dá)、純化目的蛋白。用ELISA方法分別對37例囊型包蟲、29例泡型包蟲患者、16例正常人的血清
3、檢出率測定,了解其診斷價(jià)值。
結(jié)果:1.EgEF-1親水性得分較高的區(qū)域有7個;6個柔性區(qū)域;抗原性指數(shù)得分較高的區(qū)域分布與柔性區(qū)域一致;表面可及性得分較高的區(qū)域較少;可能的B細(xì)胞線性表位區(qū)域是:120-130、286-295、306-320、365-378;可能的優(yōu)勢性T細(xì)胞表位區(qū)域是:34-48、164-177、222-244、280-290、321-330、396-407;EgEF-1的二級結(jié)構(gòu)中α螺旋占32.81%、β
4、折疊22.54%、β轉(zhuǎn)角10.94%、無規(guī)則卷曲33.71%;序列比對,EgEF-1與人類EF-1的一致性為35.06%,EgTPI與人類TPI的一致性為8%。EgTPI親水性得分較高的區(qū)域有8個;8個柔性區(qū)域;抗原性指數(shù)得分較高的區(qū)域分布與柔性區(qū)域大部分一致;表面可及性得分較高的區(qū)域分布區(qū)域相對較少;可能的B細(xì)胞線性表位的氨基酸序列為:28-39、50-60、70-80、131-139、150-159、213-231。EgTPI二級結(jié)
5、構(gòu)中α螺旋占36%、β折疊22.00%、β轉(zhuǎn)角12.00%、無規(guī)則卷曲30.00%;可能的優(yōu)勢性T細(xì)胞表位區(qū)域?yàn)椋?6-30、71-85、98-119、142-154、178-200。2.成功構(gòu)建重組表達(dá)載體,誘導(dǎo)純化出重組蛋白EgEF-1的分子量在34KD左右,EgTPI的分子量在27KD左右。ELISA結(jié)果顯示,EgEF-1血清檢測陽性率為0,但OD值普遍較高,EgTPI細(xì)粒棘球蚴病患者陽性檢出率為86.48%,多房棘球蚴患者陽性檢
6、出率為72.41%,與健康人群比較,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),但CE和AE間差異沒有顯著性。
結(jié)論:1.通過對抗原表位的預(yù)測,EgEF-1有4個B細(xì)胞表位的區(qū)域、6個優(yōu)勢性T細(xì)胞表位區(qū)域,EgTPI有6個可能形成B細(xì)胞表位的區(qū)域、5個優(yōu)勢性T細(xì)胞表位區(qū)域,這些抗原表位預(yù)示可作為免疫診斷和藥物治療靶點(diǎn)2.成功純化重組蛋白后,EgEF-1對兩種病人血清檢測結(jié)果無陽性例數(shù);EgTPI檢測結(jié)果表明,細(xì)?;颊吲c多房患者之間存在
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