利用SNP標(biāo)記在中國(guó)荷斯坦牛中精細(xì)定位BTA6上產(chǎn)奶性狀QTLs.pdf

1、多項(xiàng)研究已表明BTA6上存在產(chǎn)奶性狀QTLs。Chen(2005)在基于女兒設(shè)計(jì)的中國(guó)荷斯坦牛群中也檢測(cè)到產(chǎn)奶性狀QTLs，并將影響產(chǎn)奶量、乳脂量和乳蛋白量的QTLs定位在標(biāo)記BMS470附近，BMS1242附近也有一個(gè)影響乳脂量的QTL。本研究綜合目前國(guó)內(nèi)外研究進(jìn)展，借助最新公布的奶?；蚪M序列圖和遺傳圖譜選定了BTA6上熱點(diǎn)研究區(qū)域內(nèi)相對(duì)較小的區(qū)段(標(biāo)記BMS2508-ILSTS097之間)作為目標(biāo)QTL精細(xì)定位區(qū)段，利用高密度SN

2、P標(biāo)記在中國(guó)荷斯坦牛中對(duì)產(chǎn)奶性狀QTLs進(jìn)行了精細(xì)定位研究。 1．通過對(duì)公牛基因組DNA的目標(biāo)區(qū)段進(jìn)行逐段PCR擴(kuò)增和PCR產(chǎn)物直接測(cè)序方法獲得了新的SNP標(biāo)記，共得到32個(gè)新標(biāo)記。為增加標(biāo)記密度，綜合利用NCBI上已公布的目標(biāo)區(qū)段內(nèi)SNP標(biāo)記和本研究的新標(biāo)記，在25Mbp的范圍內(nèi)共選用了15個(gè)SNP標(biāo)記。采用RFLP、TaqMan探針及AFLP對(duì)來自11個(gè)公牛半同胞家系的1449個(gè)中國(guó)荷斯坦牛個(gè)體的標(biāo)記基因型進(jìn)行了檢測(cè)判定。

3、 2．通過LOKI多點(diǎn)連鎖分析，在標(biāo)記FAM13A1-PPARGClA-SLC34A2處檢測(cè)到305天產(chǎn)奶量QTL，且BF值在PPARGClA處達(dá)最大(BF=40.25)；在多個(gè)不同家系組合群體中檢測(cè)到標(biāo)記OPN處存在影響產(chǎn)奶量的QTL在標(biāo)記CR-CEPl35之間以及標(biāo)記M和STIM2之間也存在產(chǎn)奶量QTLs。對(duì)乳蛋白量的分析結(jié)果顯示，標(biāo)記PPMlK-FAM13A1和PPARGClA-SLC34A2處分別存在一個(gè)乳蛋白量QTL。乳

4、脂量的QTLs被定位在標(biāo)記STIM2-MBIP和標(biāo)記UGDH-CR之間。在本研究群體中未檢測(cè)到乳成分QTL。 3．關(guān)聯(lián)分析結(jié)果顯示，標(biāo)記FAM13A1、PPARGClA、SLC34A2、OPN、CR、CEP135、M、STIM2、PPMlK、MBIP、UGDH分別對(duì)產(chǎn)奶量，乳脂量，乳蛋白量有極顯著影響(p<0.01)。在最新的?；蚪M序列圖中，這些區(qū)段內(nèi)除了標(biāo)記STIM2-MBIP和CR-CEP135之間有相對(duì)大一些的gap以外