
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1、為了定位牛6號(hào)常染色體(BTA6)上影響產(chǎn)奶性狀的QTL,分別利用了14個(gè)已知微衛(wèi)星檢測(cè)了2650頭荷斯坦奶?;蚪M樣品的基因型。微衛(wèi)星基因型的判定依據(jù)了熒光引物-PCR結(jié)合ABI377測(cè)序儀熒光電泳掃描及GENESCANTM3.0-GenotyperTM2.5軟件分析技術(shù)。為了確認(rèn)原登記系譜的可靠性,又根據(jù)個(gè)體的微衛(wèi)星基因型進(jìn)行了個(gè)體所在親子關(guān)系的鑒定。鑒定結(jié)果保留了2356頭母牛,分別隸屬于26頭公牛的女兒,每頭公牛的女兒數(shù)在35到
2、195不等,也就是本實(shí)驗(yàn)采用的是女兒設(shè)計(jì)。另外由于產(chǎn)奶性狀的表型記錄中存在著重復(fù)記錄,這會(huì)不便于下一步的QTL定位軟件分析,所以對(duì)11,055條記錄(至少包含5個(gè)測(cè)定日)利用了MT-DFREML軟件進(jìn)行表型性狀的育種值估計(jì)。由此,將針對(duì)中國(guó)荷斯坦奶牛進(jìn)行首次大規(guī)模的QTL定位統(tǒng)計(jì)分析。對(duì)305天的產(chǎn)奶量、乳脂量、乳蛋白量、乳脂率和乳蛋白率5個(gè)產(chǎn)奶分性狀的QTL定位,本研究主要依據(jù)了兩種方法:基于線性回歸的QTLExpress分析和基于方
3、差組分分析的MQREML方法。利用QTLExpress進(jìn)行26個(gè)公牛家系間的單QTL分析時(shí),發(fā)現(xiàn)作用著產(chǎn)奶量、乳脂量、乳蛋白量和乳脂率四個(gè)性狀的QTL均定位在標(biāo)記BMS470位置. 由于MQREML涉及到的統(tǒng)計(jì)算法計(jì)算量的有限,所以該方法只是利用QTLExpress檢測(cè)到的顯著家系進(jìn)行有關(guān)性狀的QTL定位分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn):對(duì)于其中的3個(gè)量性狀,均能檢測(cè)到QTL顯著存在(P<=0.02);但是對(duì)于2個(gè)率性狀卻沒能檢測(cè)到,并且區(qū)間定位的最
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