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文檔簡介
1、分類號UDC密級編號角方霜糾大膨碩士學位論文結(jié)直腸腫瘤的黏膜微生物分析研究Analysisofmucosa—associatedmicrobiotaincolorectaltumor導師姓名專業(yè)名稱培養(yǎng)類型論文提交日期許可寒學術(shù)型摘要結(jié)直腸腫瘤的黏膜微生物分析研究碩士研究生:許可寒指導教師:姜泊摘要研究背景:結(jié)直腸腫瘤是一種常見的消化道腫瘤,其中結(jié)直腸癌己成為世界上發(fā)病率排名第三及造成居民死亡排名第四位的惡性腫瘤。在我國常見的惡性腫瘤死
2、亡病例中,結(jié)直腸癌也占有很高的比例,并且近幾年其發(fā)病率有逐漸增加的趨勢,嚴重影響了人民的身體健康。結(jié)直腸腫瘤的發(fā)生發(fā)展與遺傳、生活方式及環(huán)境等多種因素相關(guān),目前有研究表明腸道微生物與結(jié)直腸腫瘤的發(fā)生發(fā)展有密切的聯(lián)系,但關(guān)于腸道微生物與結(jié)直腸腫瘤發(fā)生的確切關(guān)系尚不清楚。有兩種關(guān)于腸道菌群與結(jié)直腸癌關(guān)系的假說,分別是“Alpha—Bugs”假說和“driverpassenger’假說。目的和意義:在本文中我們通過對來源于不同患者腸道黏膜的微
3、生物進行分析,為了找出結(jié)直腸腫瘤不同階段的腸道黏膜微生物的差異,同時我們還想尋找與結(jié)直腸腫瘤相關(guān)的黏膜微生物標記物。研究方法:本文中所用到的的腸道微生物樣本來源于2015年10月NatureCommunication上發(fā)表的一篇文獻,樣本的微生物序列是從NCBI的SPA數(shù)據(jù)庫中下載得到的,所有的序列信息都是公開的。微生物序列經(jīng)過去噪處理后,先利用UPARSE軟件將所有的序列在95%相似度下進行聚類得到OTU,然后使用利用UCHIME將P
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