應用16s rRNA基因序列分析鑒定非典型細菌的實驗研究.pdf

1、目的：建立以16SrRNA基因序列分析為基礎的細菌鑒定方法，并初步將其應用于臨床微生物常規(guī)細菌鑒定，評價其在常規(guī)細菌鑒定中的鑒定效能。
　　方法：選擇臨床微生物實驗室不能準確鑒定的細菌13株，以16SrRNA為靶序列，在兩端保守區(qū)設計引物，PCR擴增目的片段，測序后與數據庫中已知細菌的16SrRNA序列進行序列比對。相似度大于99％的細菌判定為同種細菌，相似度介于95％～99％之間則判定為同屬，相似度在91％～95％之間判定為同科

2、。
　　結果：13株菌中，有11株菌的16srRNA基因序列與數據庫的比對結果相似性達99％以上，占84.6％，包括陰溝腸桿菌、Cowanii腸桿菌、表皮葡萄球菌、金黃色葡萄球菌、土生拉烏爾菌、鮑曼不動桿菌、巴黎鏈球菌、鉛黃腸球菌、副血鏈球菌、Uruburuella suis、空腸彎曲菌，成功鑒定到種的水平；魯氏不動桿菌的16SrRNA基因序列與數據庫的比對結果相似性為95％，僅能鑒定到屬的水平。
　　結論：16SrRNA基