糖尿病腎陰虛證lncRNA-mRNA表達(dá)譜的研究.pdf

1、目的：以2型糖尿病腎陰虛證患者、2型糖尿病非腎陰虛證患者、正常人作為研究對象，篩選出與T2DM腎陰虛證、T2DM非腎陰虛證相關(guān)的差異lncRNA和mRNA，探討差異lncRNA在T2DM腎陰虛證中的可能作用機(jī)制。
　　方法：1.采用lncRNA/mRNA芯片進(jìn)行基因表達(dá)譜檢測，三組數(shù)據(jù)進(jìn)行兩兩對比，得到差異mRNA，再將差異mRNA注入GO和KEGG數(shù)據(jù)庫，進(jìn)行生物學(xué)進(jìn)程、細(xì)胞組分、分子功能分析，及生物信號通路分析。
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2、.采用lncRNA/mRNA芯片進(jìn)行基因表達(dá)譜檢測，三組數(shù)據(jù)進(jìn)行兩兩對比，得到差異lncRNA，再對差異lncRNA進(jìn)行靶基因的預(yù)測。將靶基因與差異mRNA進(jìn)行聯(lián)合分析，從中找出可能與T2DM腎陰虛證、T2DM非腎陰虛證的發(fā)病相關(guān)的lncRNA，并對其可能的作用機(jī)制進(jìn)行探討。
　　結(jié)果：1.mRNA基因表達(dá)譜：在T2DM腎陰虛組與T2DM非腎陰虛組的比較中，發(fā)現(xiàn)差異表達(dá)的mRNA基因數(shù)為117條，其中上調(diào)mRNA數(shù)為37條，下調(diào)m

3、RNA數(shù)為80條。GO分析發(fā)現(xiàn)，差異表達(dá)的mRNA參與了多種生物學(xué)進(jìn)程，尤其是在免疫和刺激反應(yīng)方面。KEGG分析發(fā)現(xiàn)差異表達(dá)的mRNA涉及13條信號通路。在T2DM腎陰虛組與正常對照組的比較中，發(fā)現(xiàn)差異表達(dá)的mRNA基因數(shù)為107條，其中上調(diào)mRNA數(shù)為88條，下調(diào)mRNA數(shù)為19條。差異表達(dá)的mRNA參與了多種生物學(xué)進(jìn)程，尤其是在免疫和刺激反應(yīng)方面。KEGG分析發(fā)現(xiàn)差異表達(dá)的mRNA涉及9條信號通路。在T2DM非腎陰虛組與正常對照組的

4、比較中，發(fā)現(xiàn)差異表達(dá)的mRNA基因數(shù)為89條，其中上調(diào)mRNA數(shù)為67條，下調(diào)mRNA數(shù)為22條。差異表達(dá)的mRNA參與了多種生物學(xué)進(jìn)程，尤其是在免疫和刺激反應(yīng)方面。KEGG分析發(fā)現(xiàn)差異表達(dá)的mRNA涉及8條信號通路。
　　2.lncRNA基因表達(dá)譜：在T2DM腎陰虛組與T2DM非腎陰虛組的比較中，發(fā)現(xiàn)差異表達(dá)的lncRNA基因數(shù)為208條，其中上調(diào)lncRNA數(shù)為64條，下調(diào)lncRNA數(shù)為144條。預(yù)測得到可能具有cis調(diào)控作

5、用的lncRNA有162條，可能具有trans調(diào)控作用的lncRNA有63條。篩選出的靶基因在差異mRNA數(shù)據(jù)中有改變的lncRNA9條。在T2DM腎陰虛組與正常對照組的比較中，發(fā)現(xiàn)差異表達(dá)的lncRNA基因數(shù)為275條，其中上調(diào)lncRNA數(shù)為217條，下調(diào)lncRNA數(shù)為58條。預(yù)測得到可能具有cis調(diào)控作用的lncRNA有161條，可能具有trans調(diào)控作用的lncRNA有107條。篩選出的靶基因在差異mRNA數(shù)據(jù)中有改變的lnc

6、RNA8條。在T2DM非腎陰虛組與正常對照組的比較中，發(fā)現(xiàn)差異表達(dá)的lncRNA基因數(shù)為309條，其中上調(diào)lncRNA數(shù)為100條，下調(diào)lncRNA數(shù)為209條。預(yù)測得到可能具有cis調(diào)控作用的lncRNA有223條，可能具有trans調(diào)控作用的lncRNA有116條。篩選出的靶基因在差異mRNA數(shù)據(jù)中有改變的lncRNA6條。
　　結(jié)論：T2DM腎陰虛證、T2DM非腎陰虛證的發(fā)生、發(fā)展與細(xì)胞的免疫和刺激反應(yīng)均有著密切的關(guān)系。NF

7、-κB信號通路、MAPK信號通路、AMPK信號通路在T2DM腎陰虛的發(fā)生、發(fā)展過程中，發(fā)揮了調(diào)節(jié)作用。NF-κB信號通路、Wnt信號通路在T2DM非腎陰虛證的發(fā)生、發(fā)展中發(fā)揮了調(diào)節(jié)作用。lncRNA AK125889可能通過降低機(jī)體抗病原體感染的能力，從而導(dǎo)致了T2DM腎陰虛證的發(fā)生，同時通過促進(jìn)機(jī)體氧化應(yīng)激反應(yīng)的發(fā)生，使細(xì)胞生理功能紊亂，引起T2DM非腎陰虛的發(fā)生。lncRNA AF116618可能通過抑制AMPK信號通路，使細(xì)胞、機(jī)

8、體的能量供應(yīng)受阻，促進(jìn)T2DM腎陰虛的發(fā)生、發(fā)展。lncRNA AK126161可能通過影響PKA信號通路的表達(dá)，而促進(jìn)T2DM腎陰虛的發(fā)生、發(fā)展。lncRNA NR_024151的表達(dá)減少，降低了細(xì)胞對免疫復(fù)合物的吞噬和清除作用，而導(dǎo)致了T2DM腎陰虛的發(fā)生。因此，lncRNA AK125889、AF AF116618、AK126161、NR_024151有可能是T2DM腎陰虛、T2DM非腎陰虛在疾病和證侯診斷的生物標(biāo)志物，及有潛在價