蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)折疊分析與速率預(yù)測.pdf

1、蛋白質(zhì)是生物體內(nèi)存在最多的物質(zhì)，在生命體的各項(xiàng)活動中擔(dān)當(dāng)著重要的角色。蛋白質(zhì)的折疊問題是生物物理學(xué)的重要課題之一，主要研究蛋白質(zhì)的序列、結(jié)構(gòu)與功能三者之間的關(guān)系。蛋白質(zhì)折疊研究的兩個(gè)方向?yàn)?結(jié)構(gòu)與序列之間的關(guān)系，以及序列、結(jié)構(gòu)和折疊速率的關(guān)系。
　　1、熒光光譜法在研究蛋白質(zhì)的折疊構(gòu)象變化及對蛋白質(zhì)進(jìn)行定量分析方面都起到重要的作用。本章探討了熒光光譜的概念、發(fā)光機(jī)理及特點(diǎn)，分析了熒光光譜法研究蛋白質(zhì)折疊的機(jī)理，對熒光光譜技術(shù)在檢測

2、蛋白質(zhì)的構(gòu)象變化、測定蛋白質(zhì)含量以及性質(zhì)方面的應(yīng)用進(jìn)行了綜述。
　　2、基于蛋白質(zhì)的2D HP模型，運(yùn)用蒙特卡洛算法，在計(jì)算機(jī)上模擬了蛋白質(zhì)折疊的過程。用不同的氨基酸親疏水的劃分法，分析了五種不同疏水性特征的劃分對蛋白質(zhì)折疊的最小能量構(gòu)象及其能量值的影響情況。2D HP模型的實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明，不同的氨基酸疏水特征劃分法對同一段蛋白質(zhì)序列的折疊構(gòu)象及最小能量影響較大;同一段序列在同一種親疏水劃分法中，從序列的正向及其反向分別開始模擬蛋白

3、質(zhì)折疊構(gòu)象，蛋白質(zhì)折疊結(jié)構(gòu)的能量與蛋白質(zhì)折疊的起始位置無關(guān)，與其構(gòu)象之間存在一定的關(guān)系。
　　3、從蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)出發(fā)，預(yù)測氨基酸的親疏水性對蛋白質(zhì)折疊速率的影響。本章從20種氨基酸中的每種氨基酸親疏水值出發(fā)，分析了氨基酸的親疏水性對蛋白質(zhì)折疊速率的影響。得出結(jié)論，20種氨基酸中的每種氨基酸親疏水特征值之和是影響蛋白質(zhì)折疊速率重要因素之一。
　　4、從蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)出發(fā)，分別提取氨基酸主鏈上的碳α原子(Ca)、氮原子(N