基于XML的種豬遺傳評(píng)估系統(tǒng)的應(yīng)用研究.pdf

1、養(yǎng)豬業(yè)在畜牧業(yè)中占據(jù)著核心地位，豬肉是肉食品中蛋白質(zhì)的主要來(lái)源，養(yǎng)豬業(yè)的生產(chǎn)效益影響著整個(gè)國(guó)家畜牧業(yè)的經(jīng)濟(jì)效益乃至人民的生活水平。隨著飼料、人工、防疫和物流成本的提高，養(yǎng)豬業(yè)已經(jīng)進(jìn)入高投入、高成本、高風(fēng)險(xiǎn)、微利的發(fā)展時(shí)期，有效提高養(yǎng)豬業(yè)的產(chǎn)量和豬的質(zhì)量成為科研人員的一個(gè)重要研究課題。
　　目前世界上養(yǎng)豬業(yè)發(fā)達(dá)的國(guó)家都在大力發(fā)展遺傳育種技術(shù)，通過(guò)改良豬的遺傳基因，持續(xù)地選擇出優(yōu)良的遺傳個(gè)體繁殖后代，從而提高養(yǎng)豬業(yè)的生產(chǎn)效益。與其他遺

2、傳育種方法相比，Henderson提出的BLUP法能夠充分利用候選個(gè)體及父母、同胞、后代等所有親屬信息，顯著提高種豬遺傳育種進(jìn)展。現(xiàn)有的大多數(shù)種豬遺傳評(píng)估系統(tǒng)的數(shù)據(jù)庫(kù)基于關(guān)系模式，但關(guān)系模式在養(yǎng)豬管理存在如下不足之處：（1）每頭豬的管理內(nèi)容整齊劃一，難以滿足個(gè)體精細(xì)化管理；（2）基于數(shù)據(jù)表結(jié)構(gòu)的操作，一頭豬的有關(guān)數(shù)據(jù)分布在不同的數(shù)據(jù)表中，訪問(wèn)某頭豬的數(shù)據(jù)需要通過(guò)多重連接，嚴(yán)重影響了數(shù)據(jù)操作的效率。隨著互聯(lián)網(wǎng)的快速發(fā)展，XML廣泛應(yīng)用于數(shù)

3、據(jù)交換、電子商務(wù)交易和Internet信息傳輸?shù)阮I(lǐng)域，已成為Web上信息表示和數(shù)據(jù)交換的一個(gè)重要標(biāo)準(zhǔn)。與傳統(tǒng)關(guān)系數(shù)據(jù)庫(kù)相比，XML的簡(jiǎn)易性、靈活性和自我描述性使其易于在任何應(yīng)用程序中讀寫(xiě)數(shù)據(jù)，更適合于半結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)的存取。
　　本研究對(duì)基于關(guān)系模式的種豬遺傳評(píng)估系統(tǒng)進(jìn)行分析，針對(duì)關(guān)系模式在種豬數(shù)據(jù)管理方面的不足之處，提出了采用 XML文檔取代關(guān)系數(shù)據(jù)庫(kù)的方案。一個(gè) XML文檔集中保存一頭豬從出生至死亡的所有數(shù)據(jù)，通過(guò)外部DTD定義X

4、ML文檔結(jié)構(gòu)的規(guī)則，同時(shí)引入樹(shù)形種豬譜系，設(shè)計(jì)出基于XML的種豬遺傳評(píng)估系統(tǒng)。通過(guò)設(shè)計(jì)XML文檔集的樹(shù)形目錄管理，并且構(gòu)建標(biāo)志號(hào)生成器生成唯一的標(biāo)志號(hào)作為XML文檔的文件名，加快在XML文檔集的索引速度。并且向 XML文檔中引入種豬譜系信息，在使用BLUP方法計(jì)算種豬遺傳育種估計(jì)值過(guò)程中，利用樹(shù)形譜系能夠加快數(shù)據(jù)提取速度和改進(jìn)分子血緣相關(guān)矩陣的計(jì)算方法。
　　本研究根據(jù)用戶的需求，采用B/S開(kāi)發(fā)模式與XML技術(shù)，結(jié)合MVC三層架構(gòu)