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
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文檔簡介
1、天然產(chǎn)物(Natual Products)是普遍地存在于整個(gè)生態(tài)系統(tǒng)的特殊物質(zhì),是生物活性物質(zhì)和實(shí)用藥物發(fā)現(xiàn)的重要源泉,在人類的社會(huì)生活中扮演了重要角色。隨著抗生素耐藥性問題的日益嚴(yán)峻,迫使新藥的研發(fā)效率急需不斷提高。目前,從傳統(tǒng)分離源中分離新活性天然產(chǎn)物的幾率不斷地降低,進(jìn)而新分離源的探索不斷引起研究者的關(guān)注。昆蟲種類豐富,其分布也極為廣泛,幾乎遍布地球上的各種生境。昆蟲共生微生物的獨(dú)特活性代謝產(chǎn)物,也引起了研究者們的極大興趣。其中,
2、昆蟲共生放線菌的活性代謝產(chǎn)物研究不斷受到研究者的關(guān)注。因此,本研究以昆蟲綱中第一大目鞘翅目甲蟲為分離研究對(duì)象,進(jìn)行內(nèi)生放線菌多樣性研究。將篩選獲得的內(nèi)生放線菌進(jìn)行新種鑒定和抗病原微生物活性評(píng)價(jià),并對(duì)活性菌株的活性代謝產(chǎn)物進(jìn)行分離鑒定,結(jié)果如下:
(1)從多種昆蟲樣本中共分離得到內(nèi)生放線菌41株,通過形態(tài)特征、培養(yǎng)特征及部分16S rRNA分析,將這41株菌歸類為放線菌的4個(gè)屬,包括鏈霉菌屬(Streptomyces)27株,小
3、單孢菌屬(Micromonospora)11株,鏈孢囊菌屬(Streptosporangium)2株及野野村菌屬(Nonom uraea)1株。
(2)綜合運(yùn)用多相性分類鑒定方法對(duì)菌株NEAU-CX1進(jìn)行分類學(xué)鑒定。通過16S rRNA基因序列分析判斷該菌屬于小單孢菌屬。菌株NEAU-CX1與Micromonospora coxensis JCM13248T(99.3%),Micromonospora purpureochro
4、mogenes DSM43821T(99.1%)和Micromonospora siamensis TT2-4 JCM12769T(99.1%)的16S rRNA基因序列相似性最高,與小單孢菌屬的其它菌株的相似性均低于99%。利用鄰位連接法和最大似然法將菌株NEAU-CX1與該屬的相關(guān)菌株的16S rRNA和gryB基因進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建,分析結(jié)果表明,兩種方法得到的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)相同,菌株NEAU-CX1與M.purpureochromog
5、enes DSM43821T形成獨(dú)立分支。通過形態(tài)特征、生理生化特性、系統(tǒng)分類學(xué)及DNA雜交分析確定NEAU-CX1屬于小單孢菌屬的一個(gè)新種,命名為Micromonospora palomenae,保藏在中國科學(xué)院微生物研究所和日本理化學(xué)研究所微生物菌種保藏中心(=CGMCC4.7175T=JCM30056T)。
(3)綜合運(yùn)用多相性分類鑒定方法對(duì)菌株NEAU-JC6進(jìn)行分類學(xué)鑒定。通過16S rRNA基因序列分析判斷該菌屬于
6、小單孢菌屬。菌株NEAU-JC6與M.haikouensis DSM45626T(99.3%),M.carbonacea JCM3139T(99.1%)和M.krabiensis JCM12869T(99.1%)的16SrRNA基因序列相似性最高,與小單孢菌屬其它菌株的相似性均低于98%。利用鄰位連接法和最大似然法將菌株NEAU-JC6與該屬的相關(guān)菌株的16S rRNA和gryB基因進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建,分析結(jié)果表明,兩種方法得到的拓?fù)浣Y(jié)
7、構(gòu)相同,菌株NEAU-JC6與M.haikouensis DSM45626T形成獨(dú)立分支。通過形態(tài)特征、生理生化特性、系統(tǒng)分類學(xué)及DNA雜交分析確定NEAU-JC6屬于小單孢菌屬的一個(gè)新種,命名為Micromonospora harpali,保藏在中國科學(xué)院微生物研究所和日本理化學(xué)研究所微生物菌種保藏中心(=CGMCC4.7173T=JCM30055T)。
(4)綜合運(yùn)用多相性分類鑒定方法對(duì)菌株NEAU-FHSN1進(jìn)行分類學(xué)鑒
8、定。通過16SrRNA基因序列分析判斷該菌屬于鏈孢囊菌屬。菌株NEAU-FHSN1與Streptosporangtumshengliensis NEAU-GH7T(98.7%)的16S rRNA基岡序列相似性最高。利用鄰位連接法和最大似然法將菌株NEAU-FHSN與該屬的相關(guān)菌株的16S rRNA基因進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建,分析結(jié)果表明,兩種方法得到的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)相同,菌株NEAU-FHSN1與Streptosporangtum roseumJ
9、CM3005T(98.6%),Streptosporangtum vulgare DSM43802T(98.6%),Streptosporangtumcanum HBUM170018T(98.5%)和Streptosporangtum album DSM43023T(98.4%)形成一個(gè)獨(dú)立的分枝,與最高相似度菌株S.shengliensis NEAU-GH7T(98.7%)分枝距離較遠(yuǎn)。通過形態(tài)特征、生理生化特性、系統(tǒng)分類學(xué)及DNA雜
10、交分析確定NEAU-FHSN1屬于鏈孢囊菌屬的一個(gè)新種,命名為Streptosporangium lutulentum,保藏在中國科學(xué)院微生物研究所和德國不倫瑞克市德國菌種保藏中心(=CGMCC4.7141T=DSM46740T)。
(5)通過對(duì)41株共生放線菌進(jìn)行生物活性體外測試,得到2株生物活性較好的菌株,分別為C7(NEAU-TLV1)和C24(NEAU-T4),其中C7發(fā)酵產(chǎn)物對(duì)受試細(xì)菌活性較好,C24發(fā)酵產(chǎn)物對(duì)受試植
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