改進(jìn)的非負(fù)矩陣分解算法在miRNA與基因互作關(guān)系的研究.pdf

1、miRNA是近年來(lái)發(fā)現(xiàn)的一種非編碼的小分子單鏈RNA，一般長(zhǎng)度約為22個(gè)核苷酸。從被發(fā)現(xiàn)命名、大規(guī)模挖掘、對(duì)靶基因進(jìn)行鑒定和預(yù)測(cè)以來(lái)，miRNA受到了廣泛的關(guān)注。miRNA主要通過轉(zhuǎn)錄后調(diào)節(jié)的機(jī)制和調(diào)控多樣性的靶基因廣泛地影響著生物體的各種生理病理進(jìn)程。目前，越來(lái)越多的研究人員對(duì)miRNA在各種疾病的診斷和治療等方面的應(yīng)用寄予了極高的厚望。本文利用非負(fù)矩陣分解算法和粒子群優(yōu)化算法對(duì)miRNA與基因的互作關(guān)系展開了深入的探索，主要包括如下

2、。
　　首先本文采用非負(fù)矩陣分解算法對(duì)miRNA、基因數(shù)據(jù)進(jìn)行整合，在基于已知的基因與基因互作數(shù)據(jù)和已知的 miRNA與基因互作關(guān)系上，得出了50對(duì)新的miRNA與基因互作關(guān)系對(duì)，同時(shí)用收斂圖檢測(cè)了本算法在這問題上是收斂有效的，并對(duì)這50個(gè)關(guān)系對(duì)的生物學(xué)意義做部分闡述；其次，由于非負(fù)矩陣分解算法在對(duì)miRNA與基因整合時(shí)，并沒有考慮到得出的miRNA與基因互作關(guān)系的生物學(xué)統(tǒng)計(jì)意義，我們?cè)诨谏鲜鏊惴ǖ幕A(chǔ)上，引入粒子群優(yōu)化算法，對(duì)