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文檔簡介
1、miRNA是近年來發(fā)現(xiàn)的一種非編碼的小分子單鏈RNA，一般長度約為22個核苷酸。從被發(fā)現(xiàn)命名、大規(guī)模挖掘、對靶基因進(jìn)行鑒定和預(yù)測以來，miRNA受到了廣泛的關(guān)注。miRNA主要通過轉(zhuǎn)錄后調(diào)節(jié)的機制和調(diào)控多樣性的靶基因廣泛地影響著生物體的各種生理病理進(jìn)程。目前，越來越多的研究人員對miRNA在各種疾病的診斷和治療等方面的應(yīng)用寄予了極高的厚望。本文利用非負(fù)矩陣分解算法和粒子群優(yōu)化算法對miRNA與基因的互作關(guān)系展開了深入的探索，主要包括如下
2、。
首先本文采用非負(fù)矩陣分解算法對miRNA、基因數(shù)據(jù)進(jìn)行整合，在基于已知的基因與基因互作數(shù)據(jù)和已知的 miRNA與基因互作關(guān)系上，得出了50對新的miRNA與基因互作關(guān)系對，同時用收斂圖檢測了本算法在這問題上是收斂有效的，并對這50個關(guān)系對的生物學(xué)意義做部分闡述；其次，由于非負(fù)矩陣分解算法在對miRNA與基因整合時，并沒有考慮到得出的miRNA與基因互作關(guān)系的生物學(xué)統(tǒng)計意義，我們在基于上述算法的基礎(chǔ)上，引入粒子群優(yōu)化算法，對
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