microRNA與人類疾病關(guān)聯(lián)的預(yù)測方法研究與實現(xiàn).pdf

1、microRNA(miRNA)是一類長度為22nt左右的內(nèi)源性非編碼 RNA,通過堿基序列互補配對的方式對靶標 mRNA的表達進行調(diào)控,從而控制基因的表達?；虻漠惓Ｐ员磉_成為多種疾病發(fā)生的重要因素,因此 miRNA對疾病的產(chǎn)生和發(fā)展起到了重要的作用。本文是根據(jù)現(xiàn)有 miRNA-疾病關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)預(yù)測新的疾病關(guān)聯(lián)miRNA。
　　首先,依據(jù) miRNA與疾病數(shù)據(jù)庫 HMDD中已知的 miRNA和疾病關(guān)聯(lián),同時綜合國際醫(yī)藥數(shù)據(jù)庫對每個疾病

2、的標注,我們改進了計算兩個疾病間相似性的方法,進而計算兩個 miRNA間的功能相似性。在此基礎(chǔ)上,建立了miRNA功能相似性網(wǎng)絡(luò)。
　　其次,基于功能相似的 miRNA可能調(diào)控相似的疾病的前提,我們提出了基于 K個最相似鄰居的疾病關(guān)聯(lián) miRNA預(yù)測方法。此外,我們還考慮了miRNA家族和人類 miRNA分簇分布的特點,提出了基于加權(quán)的疾病關(guān)聯(lián)miRNA預(yù)測方法。基于整個miRNA功能相似性網(wǎng)絡(luò)的信息,我們還提出了基于隨機游走的預(yù)