microRNA與人類疾病關(guān)聯(lián)的預(yù)測(cè)方法研究與實(shí)現(xiàn).pdf

1、microRNA(miRNA)是一類長(zhǎng)度為22nt左右的內(nèi)源性非編碼 RNA,通過(guò)堿基序列互補(bǔ)配對(duì)的方式對(duì)靶標(biāo) mRNA的表達(dá)進(jìn)行調(diào)控,從而控制基因的表達(dá)?；虻漠惓Ｐ员磉_(dá)成為多種疾病發(fā)生的重要因素,因此 miRNA對(duì)疾病的產(chǎn)生和發(fā)展起到了重要的作用。本文是根據(jù)現(xiàn)有 miRNA-疾病關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)預(yù)測(cè)新的疾病關(guān)聯(lián)miRNA。
　　首先,依據(jù) miRNA與疾病數(shù)據(jù)庫(kù) HMDD中已知的 miRNA和疾病關(guān)聯(lián),同時(shí)綜合國(guó)際醫(yī)藥數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)每個(gè)疾病

2、的標(biāo)注,我們改進(jìn)了計(jì)算兩個(gè)疾病間相似性的方法,進(jìn)而計(jì)算兩個(gè) miRNA間的功能相似性。在此基礎(chǔ)上,建立了miRNA功能相似性網(wǎng)絡(luò)。
　　其次,基于功能相似的 miRNA可能調(diào)控相似的疾病的前提,我們提出了基于 K個(gè)最相似鄰居的疾病關(guān)聯(lián) miRNA預(yù)測(cè)方法。此外,我們還考慮了miRNA家族和人類 miRNA分簇分布的特點(diǎn),提出了基于加權(quán)的疾病關(guān)聯(lián)miRNA預(yù)測(cè)方法。基于整個(gè)miRNA功能相似性網(wǎng)絡(luò)的信息,我們還提出了基于隨機(jī)游走的預(yù)