斑馬魚胚胎圖像神經(jīng)元檢測算法研究.pdf

1、斑馬魚胚胎圖像神經(jīng)元的檢測作為觀察不同藥物作用效果的重要手段，對藥物篩選的研究有著重要意義。先前的斑馬魚圖像神經(jīng)元分析的研究大多是基于人工標(biāo)記的感興趣區(qū)域或是專家肉眼檢測的結(jié)果。由于人工觀察和分析較為主觀且煩瑣耗時(shí)，不利于重現(xiàn)實(shí)驗(yàn)結(jié)果和分析大量數(shù)據(jù)。因此，有必要研究一種斑馬魚顯微圖像神經(jīng)元自動(dòng)檢測算法，提高神經(jīng)元檢測的效率。這也為發(fā)展高通量斑馬魚圖像的計(jì)算機(jī)量化及分析工具奠定基礎(chǔ)。
　　 論文在充分分析斑馬魚圖像特點(diǎn)的基礎(chǔ)上，提

2、出了一套快速、準(zhǔn)確的斑馬魚神經(jīng)元自動(dòng)檢測方案。首先，論文采用了基于形態(tài)學(xué)運(yùn)算的分割方法，將斑馬魚胚胎從背景中分割出來。然后結(jié)合包含神經(jīng)元的感興趣區(qū)域的位置及形態(tài)特點(diǎn)，利用圖像位置校準(zhǔn)、分水嶺算法、自適應(yīng)閾值二值化、邊界曲線擬合及最近鄰域內(nèi)插等五種算法的有機(jī)組合自動(dòng)提取胚胎的感興趣區(qū)域，并統(tǒng)計(jì)感興趣區(qū)域的中心線長度及曲率。最后，論文在傳統(tǒng)細(xì)胞計(jì)數(shù)的圖像標(biāo)號算法基礎(chǔ)上提出了一種基于連通域跟蹤的神經(jīng)元計(jì)數(shù)算法，并與環(huán)形Hough變換檢測神經(jīng)元