人腫瘤壞死因子hTNF-α的生物信息學(xué)研究.pdf

1、TNF-α是一類重要的細(xì)胞因子，由活化的巨噬細(xì)胞和T細(xì)胞產(chǎn)生，具有多種生理活性，主要參與炎癥反應(yīng)并能選擇性地引起腫瘤組織壞死，有著廣泛的臨床應(yīng)用前景。但臨床的毒副作用限制了它的進(jìn)一步應(yīng)用。現(xiàn)有的研究結(jié)果表明，蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能有著密切的關(guān)系。生物信息學(xué)為我們提供了一條可以直接由基因或蛋白質(zhì)序列進(jìn)行蛋白質(zhì)功能預(yù)測(cè)和結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)的捷徑。
　　 本文嘗試?yán)蒙镄畔W(xué)的方法和軟件對(duì)腫瘤壞死因子的蛋白質(zhì)序列進(jìn)行研究比對(duì)，目的是找到序列和活性

2、之間的聯(lián)系，以期進(jìn)一步指導(dǎo)人們合理有效地設(shè)計(jì)出高效低毒的hTNF-α衍生物，為hTNF-α應(yīng)用于臨床提供一條新路。
　　 通過對(duì)人腫瘤壞死因子h-TNFA氨基酸序列和與之有不同程度一致性的各物種的TNFA、TNFB、TNFC、CD40L、TNF10、TNF11、TNF13、TNF14等的氨基酸序列進(jìn)行兩兩比對(duì)結(jié)果顯示和文獻(xiàn)報(bào)道的完全一致。此外還有一些新的發(fā)現(xiàn)：人腫瘤壞死因子氨基酸序列有一些高度保守的位點(diǎn)，其中102位和104位在

3、文獻(xiàn)里鮮有提及；保守性位點(diǎn)多集中于片層中的折疊股內(nèi)，尤其集中在A4、A5和A3，其次是B2、B2和B3。突變位點(diǎn)多集中與連接折疊股的長(zhǎng)環(huán)處，特別是在L3和L4內(nèi)。轉(zhuǎn)角處常非常保守，提示轉(zhuǎn)角處殘基有重要作用；人腫瘤壞死因子氨基酸序列N端前10個(gè)殘基常發(fā)生突變，但8位在所有的TNFL6氨基酸序列中非常保守，沒有發(fā)生任何突變。9位、10位常發(fā)生保守性突變?？梢詳喽?，人腫瘤壞死因子氨基酸序列中的保守位點(diǎn)和人腫瘤壞死因子的三維結(jié)構(gòu)以及生物活性有著