人腫瘤壞死因子hTNF-α的生物信息學研究.pdf

1、TNF-α是一類重要的細胞因子，由活化的巨噬細胞和T細胞產(chǎn)生，具有多種生理活性，主要參與炎癥反應并能選擇性地引起腫瘤組織壞死，有著廣泛的臨床應用前景。但臨床的毒副作用限制了它的進一步應用。現(xiàn)有的研究結(jié)果表明，蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能有著密切的關(guān)系。生物信息學為我們提供了一條可以直接由基因或蛋白質(zhì)序列進行蛋白質(zhì)功能預測和結(jié)構(gòu)預測的捷徑。
　　 本文嘗試利用生物信息學的方法和軟件對腫瘤壞死因子的蛋白質(zhì)序列進行研究比對，目的是找到序列和活性

2、之間的聯(lián)系，以期進一步指導人們合理有效地設計出高效低毒的hTNF-α衍生物，為hTNF-α應用于臨床提供一條新路。
　　 通過對人腫瘤壞死因子h-TNFA氨基酸序列和與之有不同程度一致性的各物種的TNFA、TNFB、TNFC、CD40L、TNF10、TNF11、TNF13、TNF14等的氨基酸序列進行兩兩比對結(jié)果顯示和文獻報道的完全一致。此外還有一些新的發(fā)現(xiàn)：人腫瘤壞死因子氨基酸序列有一些高度保守的位點，其中102位和104位在

3、文獻里鮮有提及；保守性位點多集中于片層中的折疊股內(nèi)，尤其集中在A4、A5和A3，其次是B2、B2和B3。突變位點多集中與連接折疊股的長環(huán)處，特別是在L3和L4內(nèi)。轉(zhuǎn)角處常非常保守，提示轉(zhuǎn)角處殘基有重要作用；人腫瘤壞死因子氨基酸序列N端前10個殘基常發(fā)生突變，但8位在所有的TNFL6氨基酸序列中非常保守，沒有發(fā)生任何突變。9位、10位常發(fā)生保守性突變?？梢詳喽?，人腫瘤壞死因子氨基酸序列中的保守位點和人腫瘤壞死因子的三維結(jié)構(gòu)以及生物活性有著