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文檔簡介
1、背景
潰瘍性結(jié)腸炎(ulcerativecolitis,UC)是炎癥性腸?。╥nflammatoryboweldisease,IBD)的一種,其病變主要累及結(jié)腸黏膜和黏膜下層。目前,本病確切病因還不十分清楚,遺傳、免疫、感染因素可能在本病發(fā)病中發(fā)揮重要作用,其中腸道黏膜對(duì)腔內(nèi)細(xì)菌免疫功能失調(diào),致炎細(xì)胞因子分泌增多可能是主要的發(fā)病機(jī)制。因此明確腸道炎癥過程中信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)過程,有助于闡明UC的發(fā)病機(jī)制。
MicroRNA是一
2、類長度約為20-25個(gè)核苷酸的內(nèi)源性非編碼單鏈RNA(nocodingRNA,ncRNA),其可通過結(jié)合靶基因3’端非翻譯區(qū),并根據(jù)互補(bǔ)程度的不同指導(dǎo)沉默復(fù)合體降解靶mRNA或者阻制mRNA的翻譯。通過調(diào)控基因的表達(dá),miRNA廣泛參與生命過程中一系列重要進(jìn)程,如組織器官的形成、細(xì)胞分化、增殖、凋亡、信號(hào)通路的調(diào)控、炎癥發(fā)生、腫瘤形成等等。本研究旨在探討miRNA-155及其靶基因可能在UC發(fā)病機(jī)制中的作用,為研究UC找到新的切入點(diǎn)。<
3、br> 目的
本研究利用前期UC患者和正常人結(jié)腸黏膜miRNA表達(dá)芯片,應(yīng)用生物信息學(xué)及文獻(xiàn)復(fù)習(xí)等方法篩選表達(dá)差異的miRNA及其靶基因,并探討miRNA-155及其靶基因在UC腸道黏膜炎癥發(fā)展中的作用及機(jī)制,為進(jìn)一步闡明UC發(fā)病機(jī)制提供依據(jù),并為尋找新的UC治療靶點(diǎn)提出可能的分子基礎(chǔ)。
方法
1.對(duì)前期miRNA芯片進(jìn)行分析,找出差異表達(dá)的miRNA,進(jìn)行文獻(xiàn)復(fù)習(xí),確定miR-155為主要研究對(duì)象。實(shí)時(shí)
4、定量RT-PCR法檢測UC患者和健康對(duì)照組結(jié)腸黏膜組織中miR-155的表達(dá)差異。
2.利用Targetscan等多種軟件預(yù)測miR-155靶基因,Westernblot法檢測UC患者和健康對(duì)照組結(jié)腸黏膜中靶基因FOXO3a的表達(dá)變化。構(gòu)建靶基因FOXO33’UTR表達(dá)載體和突變體,利用熒光素酶報(bào)告系統(tǒng)檢測該基因與miR-155之間的關(guān)系,并過表達(dá)和抑制表達(dá)miR-155進(jìn)一步檢測FOXO3a蛋白水平的變化。
3.在
5、TNF-α刺激HT29細(xì)胞模型中,通過ELISA等方法檢測轉(zhuǎn)染miR-155和FOXO3a-siRNA后下游IL-8的表達(dá)變化。
結(jié)果
1.通過分析前期miRNA芯片結(jié)果及文獻(xiàn)復(fù)習(xí),選擇上調(diào)顯著的miR-155進(jìn)行研究;利用實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR法檢測發(fā)現(xiàn)在UC患者結(jié)腸黏膜中miR-155的表達(dá)明顯高于健康對(duì)照組。
2.通過Targetscan等生物信息學(xué)預(yù)測軟件,發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄因子FOXO3a可能是miR-1
6、55的靶基因;Westernblot法顯示FOXO3a蛋白水平的表達(dá)在UC組明顯低于健康對(duì)照組。
3.利用雙熒光素酶報(bào)告系統(tǒng)檢測發(fā)現(xiàn)miR-155可顯著降低FOXO33’UTR野生型組的熒光表達(dá),而轉(zhuǎn)染突變體組表達(dá)可回升;Westernblot法顯示轉(zhuǎn)染miR-155mimics組FOXO3a蛋白水平的表達(dá)明顯降低。
4.在TNF-α刺激的HT29細(xì)胞模型中,發(fā)現(xiàn)miR-155的表達(dá)隨刺激時(shí)間的延長而逐漸降低,而FO
7、XO3a蛋白水平的表達(dá)相反;在加入FOXO3a-siRNA后,ELISA法檢測IL-8水平明顯上升;加入miR-155mimics后,IL-8水平較未加入組明顯升高。
結(jié)論
本課題通過對(duì)前期miRNA芯片結(jié)果的分析,發(fā)現(xiàn)miR-155表達(dá)水平在UC組明顯高于健康對(duì)照組,并利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR在結(jié)腸黏膜中進(jìn)行驗(yàn)證;利用生物信息學(xué)和生物學(xué)功能鑒定等方法發(fā)現(xiàn)FOXO3a為miR-155的直接靶基因,并可能通過調(diào)節(jié)IL-8
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