豬FRZB、ABCF1、IGFBP2和BMP-3b基因SNPs檢測(cè)及其與生產(chǎn)性狀的關(guān)聯(lián)分析.pdf

1、隨著分子遺傳學(xué)和分子生物學(xué)的發(fā)展，分子標(biāo)記輔助選擇已廣泛應(yīng)用于動(dòng)物育種中，其中SNP（single nucleotide polymorphism，單核苷酸多態(tài)性）是目前研究和應(yīng)用最廣的分子標(biāo)記。本研究選取了豬FRZB(Frizzled motif associated with bonedevelopment)、ABCF1(ATP-binding cassette subfamily F member1)、IGFBP2(Theinsu

2、lin-like growth factor binding protein2，胰島素樣生長(zhǎng)因子結(jié)合蛋白2)和BMP-3b（Bone morphogenetic protein-3b，骨形態(tài)發(fā)生蛋白3b）四個(gè)候選基因進(jìn)行了SNP檢測(cè)及性狀關(guān)聯(lián)分析，取得以下結(jié)果:
　　(1)FRZB基因編碼分泌型卷曲相關(guān)蛋白3(sFRP3)，屬于SFRP家族中的一員，在胚胎發(fā)育中起到了重要的作用;已有研究發(fā)現(xiàn)該基因存在三個(gè)SNP位點(diǎn)，本研究利用PC

3、R技術(shù)對(duì)該基因5'端調(diào)控區(qū)轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游-532bp處插入型SNPg.1541_1542 ins322(KF112870.1)進(jìn)行驗(yàn)證，在470頭美系大白豬群體中關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn)該位點(diǎn)與背膘厚性狀呈極顯著相關(guān)(p＜0.01)。
　　(2)ABCF1是一類跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白，已有研究表明ABCF1基因5'端調(diào)控區(qū)轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游-254bp處A/G SNP g.8472 A＞G(NC_010449.4)與初生重性狀關(guān)聯(lián)，本研究利用MspⅠ-

4、RFLP方法在630頭美系大白豬群和576頭法系大白豬群對(duì)該SNP進(jìn)行了驗(yàn)證，在美系大白豬群中該SNP與背膘厚和乳頭數(shù)均呈顯著相關(guān)(p＜0.05)，在法系大白豬群中該SNP與初生重呈顯著相關(guān)(p＜0.05)。
　　(3)IGFBP2是IGFBP家族的一員，通過(guò)與胰島素樣生長(zhǎng)因子結(jié)合進(jìn)行轉(zhuǎn)運(yùn)，并作用于肌肉等靶組織，促進(jìn)動(dòng)物生長(zhǎng)和發(fā)育;本研究利用MspⅠ-RFLP方法對(duì)該基因第三內(nèi)含子g.171C＞T(GenBank Accessio

5、n No.BV727778)進(jìn)行了SNP檢測(cè)，在383頭大×梅F2代豬群體中關(guān)聯(lián)分析結(jié)果發(fā)現(xiàn)該位點(diǎn)與背膘厚、眼肌高、眼肌寬、骨率和pH(LD)等性狀呈極顯著相關(guān)(p＜0.01)，與眼肌面積、肥肉率、瘦肥比、花油、色值(LD)和色值(BF)等性狀呈顯著相關(guān)(p＜0.05)。
　　(4)BMP-3b調(diào)控骨的生成，并且在胚胎發(fā)育中起著重要作用，本研究發(fā)現(xiàn)了BMP-3b基因翻譯起始位點(diǎn)ATG后546bp處存在SNP g.7925 A＞G(