偏最小二乘法在癌癥微陣列基因表達(dá)數(shù)據(jù)分析中的應(yīng)用.pdf

1、第二軍醫(yī)大學(xué)碩士學(xué)位論文偏最小二乘法在癌癥微陣列基因表達(dá)數(shù)據(jù)分析中的應(yīng)用姓名：金志超申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別：碩士專業(yè)：流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)學(xué)指導(dǎo)教師：賀佳20090501第二軍醫(yī)大學(xué)碩士學(xué)位論文行比較，尋找差異表達(dá)基因選取方法、分類方法、成分?jǐn)?shù)選擇的最佳組合?！窘Y(jié)果】①通過VIP值有效地提取差異表達(dá)基因；②利用VIP值篩選得到的差異表達(dá)基因結(jié)合Fisher精確檢驗(yàn)?zāi)軌驕?zhǔn)確預(yù)測(cè)肝癌的細(xì)胞遺傳學(xué)異常區(qū)域，與傳統(tǒng)的實(shí)驗(yàn)方法相比，在降低假陽性的情況下，識(shí)別效

2、率有了很大的提高：與CGMA相比較，靈敏度有了較大提高，和LSSCAP相比，本研究所用方法簡(jiǎn)便快速，識(shí)別了5q(Oain)，17q(Loss)和21q(Loss)三個(gè)LSSCAP未識(shí)別區(qū)域，并且避免了兩個(gè)疑似假陽性區(qū)域15q(Gain)和22q(Loss)的識(shí)別；③兩種基于PLS的多分類方法在經(jīng)過差異基因選取后都可以達(dá)到較好的分類效果，經(jīng)不完全交叉驗(yàn)證，VIP值法得到的差異表達(dá)基因?qū)Ψ诸愖钣欣渲登?00位基因和4個(gè)成分水平上兩種分類