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1、目的:本研究應(yīng)用表面增強(qiáng)激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜(SELDI-TOF-MS)技術(shù)篩選出肺癌血清、肺泡灌洗液(BALF)和肺癌組織差異蛋白,找出蛋白與肺癌的關(guān)系,并探討其意義。 方法:應(yīng)用SELDI-TOF-MS技術(shù)通過(guò)弱陽(yáng)離子交換蛋白芯片(WCX-2芯片)分別檢測(cè)20例肺癌患者和10例肺良性病變患者的血清、肺泡灌洗液(BALF)和肺組織勻漿中的蛋白質(zhì)圖譜,采用Protein Chip Biomarker System II-C型
2、蛋白質(zhì)芯片閱讀儀讀取芯片信息,采用Ciphergen Protein Chip3.2版本的分析軟件自動(dòng)采集數(shù)據(jù),讀取峰高值,獲得蛋白表達(dá)圖譜,進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)處理。用Biomarker Pattern軟件分析NSCLC差異蛋白并初步建立診斷模型。通過(guò)盲篩進(jìn)一步驗(yàn)證診斷模型。 結(jié)果:肺癌患者與肺良性病變患者相比較,蛋白質(zhì)有以下差別:(1)血清:發(fā)現(xiàn)20個(gè)有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異的蛋白峰,其中肺癌患者血清中顯著高表達(dá)蛋白質(zhì)波峰有14個(gè)(P<0.05)
3、,質(zhì)荷比(M/Z)分別是3270.07Da,4095.44Da,5309.20Da,5340.15Da,5852.02Da,5906.89Da,6436.01Da,6632.41Da,6933.33Da,7768.18Da,7973.40Da,8065.61Da,8691.12Da,8142.28Da;顯著低表達(dá)蛋白質(zhì)波峰有6個(gè)(P<0.05),MZ分別是2014.68 Da,2137.45 Da,2280.16Da,2503.32Da
4、,3588.92 Da,2090.78Da;采用Biomarker Pattern Software(BPS)對(duì)經(jīng)過(guò)Biomarker Wizard Software獲得的數(shù)據(jù)進(jìn)行分析處理,通過(guò)選用M/Z為2090.77 Da和2503.31 Da的差異蛋白峰建立分類樹(shù)模型,其診斷的靈敏度為90%,特異度為100%。盲篩驗(yàn)證結(jié)果顯示,其靈敏度為90%,特異度為100%,粗符合率(crude accuracy,CA)為93.33%,You
5、den指數(shù)(Youdens index,γ)為0.9。 (2) BALF:發(fā)現(xiàn)18個(gè)有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異的蛋白峰,其中肺癌組BALF中顯著高表達(dá)蛋白峰有4個(gè)(P<0.05),M/Z分別是7280.59 Da,7766.12Da,7824.82Da,11510.51Da;顯著低表達(dá)蛋白質(zhì)波峰有14個(gè)(P<0.05),M/Z分別是2368.58Da,2382.53Da,2618.62Da,3377.17Da,3448.29Da,3494.1
6、1Da,3512.82Da,4140.77Da,4996.49Da,5426.08Da,6925.46Da,10837.31Da,13160.91Da,12691.68Da。通過(guò)選用M/Z2611.61 Da和3252.80 Da的差異蛋白峰建立分類樹(shù)模型,其診斷的靈敏度為100%,特異度為100%。盲篩驗(yàn)證結(jié)果顯示,其靈敏度為95%,特異度為100%,CA為96.67%,γ為0.97。 (3)肺癌組織勻漿:發(fā)現(xiàn)11個(gè)有統(tǒng)計(jì)學(xué)差
7、異的蛋白峰,其中肺癌組織勻漿中顯著高表達(dá)蛋白質(zhì)波峰有3個(gè)(P<0.05),M/Z分別是4230.06Da,5757.93Da,11497.18Da;顯著低表達(dá)蛋白質(zhì)波峰有8個(gè)(P<0.05),M/Z分別是2301.92Da,2315.62Da,2331.54Da,2488.96Da,3507.10Da,3525.91Da,4770.84Da,4742.71Da。通過(guò)選用M/Z為5757.92 Da、4742.71 Da的差異蛋白峰建立分
8、類樹(shù)模型,其診斷的靈敏度為90%,特異度為100%。盲篩驗(yàn)證結(jié)果顯示,其靈敏度為90%,特異度為100%,CA為93.33%,γ為0.9。經(jīng)平行試驗(yàn)(parallel test),上述盲篩試驗(yàn)中,30例患者中有20例被判為肺癌患者,10例被判為肺良性病變患者。根據(jù)病理結(jié)果,20例肺癌患者中20例被準(zhǔn)確判斷,10例肺良性病變患者10例被準(zhǔn)確判斷,沒(méi)有誤判。 結(jié)論:(1)SELDI-TOF-MS技術(shù)篩選出的肺癌患者相對(duì)特異的蛋白標(biāo)記
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