水稻細胞壁基因表達調控網(wǎng)絡以及4CL基因演化模式解析.pdf

1、分類號華中農(nóng)業(yè)大學博士學位論文密級水稻細胞壁基因表達調控網(wǎng)絡以及4CL基因演化模式解析Globleprofilingofgeneexpressionpatternsinvolvedinricecellwallnetworkformatonsandanalysisof4CLgeneevolution博士研究生：郭凱學號：2010304010044指導教師：彭良才教授指導小組：彭良才教授StaffanPersson教授謝國生教授王令強副教授

2、鄒維華博士專業(yè)：生物化學與分子生物學研究方向：基因組學獲得學位名稱：理學博士獲得學位時間：2015年12月華中農(nóng)業(yè)大學生命科學與技術學院o一五年十二月水稻細胞壁基因表達調控網(wǎng)絡以及4EL基因演化模式解析目錄摘要i縮略詞表。ivAbbreviationsivl文獻綜述l11植物細胞壁l111植物細胞壁的結構1112植物細胞壁的組成3113植物細胞壁的精細結構模型712植物細胞壁合成基因””～8121纖維素合成。8123半纖維素合成1212

3、4木質素合成14125其他相關基因17126細胞壁合成基因的表達調控191261NAC轉錄因子191262NAC調控的下游基因231263MYB轉錄因子2413水稻細胞壁及其合成基因的研究進展26l。4基因芯片和二代測序技術。28141基因芯片的用途28142表達譜芯片的分析軟件29143表達譜芯片分析方法30144第二代測序技術31l。45RNAseq數(shù)據(jù)的分析方法3315基因共表達調控網(wǎng)絡33151共表達分析平臺34152基因共表達

4、調控網(wǎng)絡34153共表達調控網(wǎng)絡構建方法35l。5。4基因表達調控網(wǎng)絡的功能注釋3616系統(tǒng)生物學3717水稻轉錄組公共數(shù)據(jù)庫37184CL基因的結構以及功能解析3819分子演化學理論與方法42191自然選擇和中性演化理論42192中性檢驗與替換模型44193最大似然法與CODEML45194局部最優(yōu)分支模型查找優(yōu)化分支模型一47195計算分子進化用到的相關軟件48l。10研究的目的和意義”49第一章水稻CESA／CSL基因家族系統(tǒng)分析