竹筍細胞壁木質(zhì)化及轉(zhuǎn)錄組差異基因表達分析與功能初探.pdf

1、竹筍即竹子膨大的芽和幼嫩的莖，具有高纖低脂，營養(yǎng)齊全的特點，備受消費者青睞。但竹筍采收后很快出現(xiàn)木質(zhì)化，喪失鮮嫩可口的食用品質(zhì)，成為竹筍產(chǎn)業(yè)發(fā)展的重要限制因素。因此，探究竹筍木質(zhì)化的發(fā)生及其分子機理為進一步研究延長竹筍貯運期、降低采后損耗的新技術(shù)提供了理論支撐。本論文以毛竹筍上、中、下3個部位為試驗材料，研究了毛竹筍不同部位細胞壁的成分變化以及與木質(zhì)化有關(guān)的轉(zhuǎn)錄組差異基因的表達情況，并初步分析了半纖維素木聚糖合成的關(guān)鍵基因PeIRX10

2、在竹筍組織次生細胞壁形成中的功能。得到如下結(jié)論:
　　(1)毛竹筍不同部位因木質(zhì)化程度不同，細胞壁中各組分的含量不同。沿著竹筍的生長方向，木質(zhì)素和纖維素含量由上部到下部逐漸增加，而果膠和半纖維素的含量逐漸降低，同時木質(zhì)素合成相關(guān)酶PAL、CAD和C4H的活性也由上部到下部逐漸增加，說明毛竹筍在下部的木質(zhì)化程度高于上部和中部。
　　(2)對毛竹筍的上、中、下三個部分分別進行RNA-seq分析，共獲得了大約133.9百萬條rea

3、ds，總堿基數(shù)為18.13 Gbp。在上vs中、上vs下和中vs下的兩兩比對中，發(fā)現(xiàn)的DEG數(shù)目分別為3840、3518和3925，并對其進行功能注釋。然后篩選并分析了木質(zhì)化過程中與細胞壁代謝相關(guān)的差異基因，得到了編碼纖維素、半纖維素和木質(zhì)素合成途徑中相關(guān)酶基因的表達特點，并對其進行qRT-PCR驗證，qRT-PCR結(jié)果與RPKM值一致。與纖維素和木質(zhì)素合成相關(guān)的基因在下部和中部的表達量高于上部，這些基因在中下部表達量的上調(diào)與其較高的木