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文檔簡介
1、學校代碼:1 0 2 2 5學 號:S 1 5 5 3 3學位論文圈養(yǎng)斑嘴環(huán)企鵝的種群遺傳管理指導教師姓名:申請學位級別:論文提交日期:授予學位單位:耿廣耀楊淑慧東北林業(yè)大學、碩士 學科專業(yè): 特種經濟動物飼養(yǎng)2 0 1 5 年6 月 論文答辯日期: 2 0 1 5 年6 月東北林業(yè)大學 授予學位日期: 2 0 1 5 年6 月答辯委員會主席:論文評閱人:素夕厶櫛素大學摘要摘要斑嘴環(huán)企鵝( S p h e n i s c u sd e
2、m e r s u s ) 又名非洲企鵝,該種企鵝作為一種南半球特有觀賞鳥類于上世紀9 0 年代引入我國上海動物園,隨著動物觀賞市場需求變化,需要更多的斑嘴環(huán)企鵝來滿足廣大動物愛好者的觀賞需求。但是圈養(yǎng)在動物園的斑嘴環(huán)企鵝由于無野外種群和圈養(yǎng)種群模式小,一般采用“拉婚配”的配種方式,加之養(yǎng)殖時間長,譜系關系記錄不明確等原因,長期無計劃繁育或者被迫近親繁育,導致基因多樣性嚴重匱乏,種群發(fā)展受限。為解決以上問題,本文對動物園圈養(yǎng)斑嘴環(huán)企鵝群
3、體在線粒體D N A 和核D N A 層次進行了遺傳多樣性研究,以期確定我國圈養(yǎng)斑嘴環(huán)企鵝的親子關系、譜系關系,為斑嘴環(huán)企鵝的合理繁殖制定科學的方案。本課題主要以圈養(yǎng)在上海動物園的斑嘴環(huán)企鵝種群為研究對象,主要采用非傷害性取樣法,以4 6 只斑嘴環(huán)企鵝胸部廓羽為主要實驗樣本,利用試劑盒法提取D N A 。選擇適當?shù)囊镞M行P C R 擴增反應,擴增Z W 基因片段進行性別鑒定;利用M E G A 4 .0 、C E R V U S3 .
4、0 、P O P G E N EV e r s i o n 1 .3 2 、S T R U C T U R E2 .2 等分子生物學軟件對線粒體D N A 和核D N A 進行遺傳多樣性分析,構建種群系統(tǒng)進化樹,進行種群分析。結果如下:1 .在3 9 個斑嘴環(huán)企鵝個體中發(fā)現(xiàn)1 5 個變異位點定義了1 0 個單倍型,不同單倍型的遺傳距離在0 .0 0 2 .0 .0 1 9 之間,平均遺傳距離為0 .0 1 2 。利用N J 法構建系統(tǒng)進
5、化樹,1 0 個單倍型分化為2 個大的進化分支。利用相同的方法構建上海和已知日本種群的線粒體控制區(qū)系統(tǒng)進化樹。與M u r a t a 和M u r a k a m i ( 2 0 1 4 ) 的研究結果相同,斑嘴環(huán)企鵝存在2 個明顯的世系( A 和B ) ,且上海種群的單倍型均屬于包含單倍型數(shù)目較多的A 世系。2 .實驗用P N N 0 1 、P N N 0 3 、P N N 0 6 、P N N 0 9 、P N N 0 1 2 、
6、G 2 .2 、B 3 .2 、S h 2 C a 2 1 共8 個微衛(wèi)星位點在4 6 個樣品中共檢測到3 4 個等位基因,等位基因變化范圍在3 - 6 個。該套遺傳標記系統(tǒng)單個位點排除率在O .5 6 .0 .8 7 之間,有5 個位點的D P > 0 .8 ,其中P N N 0 9 位點的非父排除率最高為0 .8 6 9 ,8 個位點的累積個體識別力達到9 9 .9 9 %,完全可以用于斑嘴環(huán)企鵝的個體識別,檢測沒有親緣關系的
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