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文檔簡介
1、分子動力學程序是用來模擬生物分子的行為并研究它們的結(jié)構(gòu)和功能。當問題的規(guī)模固定時，分子動力學程序需要達到非常好的可擴展性。NAMD是一個可擴展的分子動力學軟件，在很多的大型計算機上它的性能都得到了非常好的驗證。紅神(RedNeurons)MPU第一版是由16個PowerPC MPC8548的處理器以3D torus(4x2x2)的形式連接而成。它是由鄧越凡教授主持設計，由上海紅神公司開發(fā)團隊開發(fā)的。在本文中，我們主要說明NAMD軟件在紅
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