小麥2B染色體新EST引物的開發(fā)與一個(gè)抗條銹病小偃麥滲入系的遺傳分析.pdf

1、通過(guò)與模式植物短柄草、水稻以及玉米等已知基因組序列的比較基因組來(lái)開發(fā)新的標(biāo)記，用于基因的精細(xì)定位、基因克隆和分子標(biāo)記輔助育種，這對(duì)于小麥優(yōu)良基因的研究和應(yīng)用具有實(shí)踐和理論價(jià)值。此外條銹病嚴(yán)重危害著小麥產(chǎn)量，條銹菌生理小種的變異致使培育的抗條銹病品種逐漸喪失抗性，對(duì)新的抗條銹病基因資源的鑒定和研究是長(zhǎng)期而緊迫的任務(wù)。本研究應(yīng)用比較基因組方法，通過(guò)小麥2B染色體EST與短柄草、水稻以及玉米基因組序列的比對(duì)信息，研究該染色體與其他三個(gè)基因組的

2、同源性關(guān)系，根據(jù)共線性區(qū)段內(nèi)基因設(shè)計(jì)新的EST引物，進(jìn)行引物的染色體定位及有效性分析。另外我們對(duì)一個(gè)小偃麥滲入系材料11C666-3進(jìn)行了抗性鑒定和遺傳分析。獲得如下研究結(jié)果:
　　1、小麥2B染色體上EST序列和三個(gè)基因組序列比對(duì)結(jié)果顯示，在三個(gè)基因組中共分布有同源性位點(diǎn)1125個(gè)，其中玉米中287個(gè)，水稻中299個(gè)，短柄草中539個(gè)，短柄草的Bd1、Bd5和水稻的Os7、Os3以及玉米的Zm7與小麥染色體2B具有較高同源性。<

3、br>　　2、短柄草Bd1染色體的13467797bp-17757616bp區(qū)段內(nèi)集中分布70個(gè)同源性位點(diǎn)，該區(qū)段與小麥2B染色體存在共線性的關(guān)系。
　　3、根據(jù)短柄草Bd1染色體上的共線性區(qū)段，下載并篩選該區(qū)段內(nèi)的短柄草基因，利用其序列設(shè)計(jì)了242條EST引物，并用中國(guó)春缺體-四體系將162條引物定位到了小麥染色體上，其中38對(duì)引物在小麥2B染色體上有擴(kuò)增位點(diǎn)。
　　4、運(yùn)用13個(gè)小麥品種（系）及材料11C666-3對(duì)染色

4、體已定位的162對(duì)引物進(jìn)行了擴(kuò)增驗(yàn)證，平均有72.0％引物能擴(kuò)增出豐富條帶，能夠擴(kuò)增的引物所占比率范圍為59.2％-88.2％，有105對(duì)引物能在材料11C666-3中擴(kuò)增。多數(shù)引物可以應(yīng)用于不同小麥群體的分子標(biāo)記分析。
　　5、對(duì)小偃麥滲入系材料11C666-3進(jìn)行了抗條銹病鑒定和遺傳分析。對(duì)材料11C666-3與感病品種綿陽(yáng)11和臺(tái)長(zhǎng)29分別做正反交，F(xiàn)1自交得F2群體，通過(guò)F1、F2分離群體和雙親本田間混合條銹菌接種、抗條銹