兩種水稻螟蟲線粒體全基因組序列分析.pdf

1、大螟(Sesamia inferens)、二化螟（Chilo suppressalis）、三化螟（Tryporyza incertulas）和臺(tái)灣稻螟(Chilo auricilius)是眾所周知的鱗翅目螟蛾總科水稻害蟲，廣泛分布于中國主要水稻種植區(qū)的重要害蟲。近年來，由于氣候、水稻品種以及種植制度的變化，在一些地區(qū)為害日趨嚴(yán)重。本文對(duì)三化螟和臺(tái)灣稻螟線粒體全基因組進(jìn)行測(cè)序及序列特征分析，并比較分析了4種水稻鉆蛀性害蟲的線粒體全基因組的

2、異同。同時(shí)，比較分析了8種螟蛾總科昆蟲線粒體基因組的特征。主要研究結(jié)果如下:
　　1.水稻三化螟線粒體全基因組為15，223bp，包含37個(gè)典型的線粒體基因（13個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因、22個(gè)轉(zhuǎn)運(yùn)RNA基因和2個(gè)核糖體RNA基因）和一個(gè)大的非編碼區(qū)（又稱控制區(qū)）。除了cox1以CGA為起始密碼子，其余12個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因均以ATN作為起始密碼子，除了nad3以TAG為終止密碼子，其余以TAA、TA和T作為終止密碼子。22個(gè)tRNA基因都

3、能形成典型的三葉草結(jié)構(gòu)，只有trnSer(AGN)基因缺失DHU臂。16S的二級(jí)結(jié)構(gòu)包含五個(gè)部分（標(biāo)記為Ⅰ，Ⅱ，Ⅳ，Ⅴ和Ⅵ）共49個(gè)環(huán)型結(jié)構(gòu)缺失區(qū)域Ⅲ，12S由3個(gè)結(jié)構(gòu)域組成共33個(gè)環(huán)型結(jié)構(gòu)。此外，三化螟線粒體基因組的控制區(qū)中有2個(gè)莖環(huán)結(jié)構(gòu)，2個(gè)微衛(wèi)星'(TA)12'和'(TA)9'，1個(gè)poly-T結(jié)構(gòu)和4個(gè)19bp的重復(fù)單元。
　　2.臺(tái)灣稻螟的全長為15，367bp，37個(gè)編碼基因的相對(duì)位置及轉(zhuǎn)錄方向與三化螟的順序一致，tR

4、NAser(AGN)基因的二級(jí)結(jié)構(gòu)中缺失DHU臂，其余tRNA基因的二級(jí)結(jié)構(gòu)均為典型的三葉草結(jié)構(gòu)，2個(gè)核糖體RNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)均和其它鱗翅目昆蟲的相似。此外，控制區(qū)中有五個(gè)結(jié)構(gòu)域，包含一個(gè)12bp重復(fù)單元和一個(gè)27bp的重復(fù)單元，兩個(gè)(TA)n微衛(wèi)星結(jié)構(gòu)和一個(gè)polyT結(jié)構(gòu)。
　　3.草螟科昆蟲有一個(gè)“TnATnG”序列的保守區(qū)位于trnY和cox1基因之間的間隔區(qū)INGS2，大螟這一區(qū)域的序列為“TAG”。草螟科昆蟲中存在一段保守

5、的序列“ATACTAAA”位于trnS2(UCN)和nad1間的間隔區(qū)IN GS4。此外，控制區(qū)中有五個(gè)重復(fù)單元，兩個(gè)(TA)n微衛(wèi)星結(jié)構(gòu)和poly T結(jié)構(gòu)，但大螟中只有一個(gè)(TA)n微衛(wèi)星結(jié)構(gòu)，而二化螟中卻沒有，大螟形成一個(gè)莖環(huán)結(jié)構(gòu)，但二化螟和臺(tái)灣稻螟中卻沒有。除了米螟和稻縱卷葉螟，其它螟蛾總科昆蟲線粒體基因組中堿基A的含量高于T，異亮氨酸，天冬酰胺，亮氨酸和苯丙氨酸是四種昆蟲中普遍存在的氨基酸，都使用雙重簡并密碼子。位于trnQ和n