兩種水稻螟蟲線粒體全基因組序列分析.pdf

1、大螟(Sesamia inferens)、二化螟（Chilo suppressalis）、三化螟（Tryporyza incertulas）和臺灣稻螟(Chilo auricilius)是眾所周知的鱗翅目螟蛾總科水稻害蟲，廣泛分布于中國主要水稻種植區(qū)的重要害蟲。近年來，由于氣候、水稻品種以及種植制度的變化，在一些地區(qū)為害日趨嚴重。本文對三化螟和臺灣稻螟線粒體全基因組進行測序及序列特征分析，并比較分析了4種水稻鉆蛀性害蟲的線粒體全基因組的

2、異同。同時，比較分析了8種螟蛾總科昆蟲線粒體基因組的特征。主要研究結果如下:
　　1.水稻三化螟線粒體全基因組為15，223bp，包含37個典型的線粒體基因（13個蛋白質編碼基因、22個轉運RNA基因和2個核糖體RNA基因）和一個大的非編碼區(qū)（又稱控制區(qū)）。除了cox1以CGA為起始密碼子，其余12個蛋白質編碼基因均以ATN作為起始密碼子，除了nad3以TAG為終止密碼子，其余以TAA、TA和T作為終止密碼子。22個tRNA基因都

3、能形成典型的三葉草結構，只有trnSer(AGN)基因缺失DHU臂。16S的二級結構包含五個部分（標記為Ⅰ，Ⅱ，Ⅳ，Ⅴ和Ⅵ）共49個環(huán)型結構缺失區(qū)域Ⅲ，12S由3個結構域組成共33個環(huán)型結構。此外，三化螟線粒體基因組的控制區(qū)中有2個莖環(huán)結構，2個微衛(wèi)星'(TA)12'和'(TA)9'，1個poly-T結構和4個19bp的重復單元。
　　2.臺灣稻螟的全長為15，367bp，37個編碼基因的相對位置及轉錄方向與三化螟的順序一致，tR

4、NAser(AGN)基因的二級結構中缺失DHU臂，其余tRNA基因的二級結構均為典型的三葉草結構，2個核糖體RNA的二級結構均和其它鱗翅目昆蟲的相似。此外，控制區(qū)中有五個結構域，包含一個12bp重復單元和一個27bp的重復單元，兩個(TA)n微衛(wèi)星結構和一個polyT結構。
　　3.草螟科昆蟲有一個“TnATnG”序列的保守區(qū)位于trnY和cox1基因之間的間隔區(qū)INGS2，大螟這一區(qū)域的序列為“TAG”。草螟科昆蟲中存在一段保守

5、的序列“ATACTAAA”位于trnS2(UCN)和nad1間的間隔區(qū)IN GS4。此外，控制區(qū)中有五個重復單元，兩個(TA)n微衛(wèi)星結構和poly T結構，但大螟中只有一個(TA)n微衛(wèi)星結構，而二化螟中卻沒有，大螟形成一個莖環(huán)結構，但二化螟和臺灣稻螟中卻沒有。除了米螟和稻縱卷葉螟，其它螟蛾總科昆蟲線粒體基因組中堿基A的含量高于T，異亮氨酸，天冬酰胺，亮氨酸和苯丙氨酸是四種昆蟲中普遍存在的氨基酸，都使用雙重簡并密碼子。位于trnQ和n