文蛤線粒體基因組序列測(cè)定及進(jìn)化分析.pdf

1、文蛤(Meretrix meretrix)屬軟體動(dòng)物門(Mollusca)、雙殼綱(Lamellibranchia)、異齒亞綱(Heterodonta)、簾蛤目(Veneroida)、簾蛤科(Veneridae)、文蛤?qū)?Meretrix)。文蛤是一種天然資源豐富的灘涂貝類,具有較高的營(yíng)養(yǎng)和藥用價(jià)值,是重要的海水增養(yǎng)殖優(yōu)良品種,也是主要出口的鮮活水產(chǎn)品之一。本研究采用PCR擴(kuò)增和基因克隆等常規(guī)分子生物學(xué)手段,并結(jié)合生物信息學(xué)方法對(duì)文蛤線

2、粒體基因組全序列進(jìn)行測(cè)定與分析。同時(shí),探討了雙殼類線粒體基因的重排,采用NJ和MP法構(gòu)建了雙殼類的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)。所獲得的主要結(jié)論如下:
　　 1.本研究所測(cè)定的文蛤線粒體基因組全序列長(zhǎng)度為19,826bp,編碼37個(gè)基因,包括2個(gè)rRNA基因、23個(gè)tRNA基因和12個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因,所有的基因都由H鏈編碼。與典型的后口動(dòng)物相比,缺失了ATP8。
　　 2.文蛤線粒體起始密碼子包括ATG、ATA和TTG,終止密碼子包括TA

3、A和TAG。
　　 3.文蛤mtDNA編碼23個(gè)tRNA,長(zhǎng)度在62 bp到71 bp之間,二級(jí)結(jié)構(gòu)保守,全部能夠折疊成典型的三葉草結(jié)構(gòu)。缺少tRNASer(AGN),但含有兩個(gè)tRNAGhn的拷貝,這在雙殼類中是首次發(fā)現(xiàn)。
　　 4.比較分析了雙殼類線粒體基因的重捧,在簾蛤科內(nèi),菲律賓蛤仔與文蛤和中華文蛤在基因排列上共享3個(gè)基因框:5’-COI-tRNALeu(CUN)-ND1-ND2-ND4L-tRNAne-3’,5