暗色佛蝗線粒體基因組全序列的測定與分析.pdf

1、暗色佛蝗（Phlaeobatenebrosa）隸屬于蝗總科（Acridoidea）、劍角蝗科（Acrididae）、佛蝗屬（Phlaeoba），本研究利用PCR直接測序的方法測定了暗色佛蝗的線粒體基因組全序列，并與劍角蝗科其它3種蝗蟲的線粒體基因組進(jìn)行了比較分析。同時聯(lián)合GenBank中所收錄的其他7科共17條蝗總科昆蟲線粒體基因，采用NJ法、ML法和Bayes法重建了蝗總科8科的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系。主要結(jié)論如下：
　　1、本研究所測定

2、的暗色佛蝗，其線粒體基因組全序列長度為15648bp。注釋結(jié)果顯示，暗色佛蝗線粒體全基因組編碼37個基因，包括13個蛋白質(zhì)編碼基因，22個tRNA基因和2個rRNA基因，以及一段位于trnI和rrnS之間的A+T富含區(qū)。
　　2、暗色佛蝗線粒體基因組基因存在明顯的AT堿基含量偏向性，全基因組AT含量為73.8%；13個蛋白質(zhì)編碼基因AT含量為73.1%；2個rRNA基因的AT含量為74.8%；22個tRNA基因AT含量為72.3%

3、。A+T富含區(qū)為線粒體基因組中AT含量最高的區(qū)域，其AT含量范圍為82.6%，這一數(shù)值明顯高于基因組平均水平和其他基因區(qū)域。
　　3、暗色佛蝗線粒體基因組的組成結(jié)構(gòu)非常緊湊，但也存在一定的間隔和重疊區(qū)域。暗色佛蝗線粒體基因之間總共有20個基因間隔區(qū)，全長140bp；5個基因重疊區(qū)，全長36bp。基因間隔在1-20bp之間，基因重疊在5-8bp之間。
　　4、劍角蝗科4種昆蟲線粒體基因組的最大間隔區(qū)均位于trnW-trnC和t

4、rnY-cox1之間，暗色佛蝗除這兩段之間還有一段位于nad4-nad4l之間，暗色佛蝗和白紋佛蝗最大間隔區(qū)均位于trnK-atp8之間，而威廉劍角蝗和中華劍角蝗則位于trnS(UCN)-nad1之間。
　　5、暗色佛蝗線粒體基因組AT含量為73.8%，白紋佛蝗為74.1%，威廉劍角蝗和中華劍角蝗均大于76%。暗色佛蝗和白紋佛蝗的蛋白質(zhì)編碼基因AT含量分別為73.1%和73.6%，威廉劍角蝗和中華劍角蝗均大于75%。暗色佛蝗和白紋

5、佛蝗控制區(qū)的AT含量分別為82.3%和83.0%，而威廉劍角蝗和中華劍角蝗均大于87%。
　　6、除中華劍角蝗cox1基因使用ACC為起始密碼子外，4種蝗蟲13個蛋白質(zhì)編碼基因均是以典型的ATN為起始密碼子。4種蝗蟲的atp8基因、atp6基因、cox3基因、nad4l基因、和nad6基因均使用TAA為終止密碼子，cox2基因使用單堿基T為終止密碼子，nad1基因使用TAG為終止密碼子。
　　7、基于線粒體基因組13個蛋白質(zhì)