豬RBP4和BMP7基因多態(tài)性及其與母豬繁殖性狀關聯(lián)分析.pdf

1、本試驗選取兩個外來品種（長白豬和大白豬）和兩個安徽本地品種（皖南黑豬和霍壽黑豬）作為試驗材料，檢測與豬繁殖性能相關候選基因視黃醇結合蛋白4(RBP4)基因、骨形態(tài)發(fā)生蛋白(BMP7)基因的單鏈核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymerphisms，SNPs）及其對長白豬、大白豬、皖南黑豬和霍壽黑豬繁殖性狀的影響。登陸 NCBI，根據(jù)已公布的豬 RBP4基因和 BMP7基因序列，設計引物，采用PCR-SSCP方法檢測

2、RBP4基因和BMP7基因部分區(qū)域的多態(tài)位點并分析該位點的多態(tài)性，運用SPSS17.0軟件中的GLM模型處理數(shù)據(jù)，將多態(tài)位點的多態(tài)性與產(chǎn)仔數(shù)相關聯(lián)。旨在尋找與地方豬繁殖性狀相關的有效遺傳標記，為安徽省地方豬種質(zhì)資源特性及MAS研究提供分子生物學參考。經(jīng)研究發(fā)現(xiàn)：
　?。?）RBP4基因和BMP7基因的SNPs檢測結果：RBP4基因的第1、5、6外顯子等引物擴增區(qū)域在四個豬種群體中均未發(fā)現(xiàn)基因突變位點；BMP7基因的第2、3、7外顯

3、子等引物擴增區(qū)域在四個豬種群體中均未發(fā)現(xiàn)基因突變位點。
　?。?）RBP4基因和 BMP7基因在試驗豬群中的基因型頻率和基因頻率：RBP4基因第3內(nèi)含子檢測到突變：A604G，長白豬、大白豬和皖南黑豬中均存在突變位點，并且都含有三種基因型（AA、AB、BB），這三個豬種群體中，優(yōu)勢等位基因均為等位基因A，大白豬和皖南黑豬的優(yōu)勢基因型均為AB型，其基因頻率分別為49.00％和43.24%，長白豬的優(yōu)勢基因型為AA型，其基因型頻率為4

4、6.23%，而在霍壽黑豬群體中沒有檢測到突變位點，均為野生型。BMP7基因第2內(nèi)含子檢測到突變：T48500Cbp，長白豬、大白豬、皖南黑豬和霍壽黑豬中均存在突變位點，并且都含有三種基因型（TT、TC、CC），在長白豬和大白豬群體中，其優(yōu)勢基因型為TT基因型，基因型頻率分別為73.58%、56%，優(yōu)勢等位基因為等位基因T，皖南黑豬和霍壽黑豬群體中，優(yōu)勢基因型均為CC基因型，其基因型頻率分別為64.84%、67.80%，優(yōu)勢基因均為等位基

5、因C。
　　（3）試驗豬種各群體的遺傳學分析：χ2檢驗表明： RBP4基因第3內(nèi)含子突變位點，在長白豬、大白豬和皖南黑豬檢測群體均處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)（P>0.05），長白豬、大白豬和皖南黑豬在該位點的多態(tài)信息含量（PIC）分別為0.3463、0.3589、0.3598，均處于中度多態(tài)。BMP7基因第2內(nèi)含子突變位點，只有在大白豬檢測群體處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)（P>0.05），在長白豬、皖南黑

6、豬和霍壽黑豬檢測群體不處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)（P<0.05），長白豬、大白豬、皖南黑豬和霍壽黑豬在該位點的多態(tài)信息含量（PIC）分別為0.2552、0.3108、0.3004和0.2782，均處于中度多態(tài)。
　?。?）RBP4基因第3內(nèi)含子多態(tài)位點與產(chǎn)仔數(shù)的相關分析：長白豬、大白豬和皖南黑豬AA基因型的總產(chǎn)仔數(shù)和產(chǎn)活仔數(shù)最高，其次是AB基因型，BB基因型的總產(chǎn)仔數(shù)和產(chǎn)活仔數(shù)最低，這三個群體中，AA基因型的總產(chǎn)仔數(shù)

7、和產(chǎn)活仔數(shù)顯著高于BB基因型個體（P<0.05），長白豬 AA基因型的產(chǎn)活仔數(shù)顯著高于 AB基因型（P<0.05），大白豬和皖南黑豬AB基因型的產(chǎn)活仔數(shù)顯著高于BB基因型（P<0.05）。
　?。?）BMP7基因第2內(nèi)含子多態(tài)位點與產(chǎn)仔數(shù)的相關分析：長白豬TC基因型的產(chǎn)活仔數(shù)顯著高于 TT基因型（P<0.05）。皖南黑豬的總產(chǎn)仔數(shù)和產(chǎn)活仔數(shù)以及霍壽黑豬CC基因型個體的總產(chǎn)仔數(shù)顯著高于TT基因型個體（P<0.05）。
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