LIF基因多態(tài)性檢測及其與母豬產(chǎn)仔性狀的關(guān)聯(lián)性分析.pdf

1、本研究以安徽省優(yōu)良地方豬種（安慶六白豬、圩豬和皖南黑豬）和外來瘦肉型豬種大白豬為試驗材料，研究動物胚胎附植相關(guān)候選基因白血病抑制因子基因（leukemia inhibitory factor，LIF）的單鏈核苷酸多態(tài)性（single nucleotide polymerphisms，SNPs）檢測及其與繁殖母豬產(chǎn)仔性狀的相關(guān)性。根據(jù)NCBI中公布的豬LIF（登錄號：AJ296176）基因外顯子序列設(shè)計引物，采用PCR-SSCP、PCR-

2、RFLP和PCR產(chǎn)物雙向測序技術(shù)檢測LIF基因第2、3外顯子部分片段的遺傳變異，篩查SNPs并分析其多態(tài)性，運用SPSS程序22.0 GLM模型分析遺傳變異與繁殖母豬產(chǎn)仔性狀的相關(guān)性，以探討利用該基因作為分子標記改良母豬產(chǎn)仔性狀的可行性，為安徽地方豬種繁殖性狀的遺傳改良提供科學(xué)根據(jù)。
　　試驗結(jié)果如下：
　　(1)LIF基因外顯子2擴增片段在安慶六白豬群體發(fā)現(xiàn)1個SNP，為LIFg.C5709T；外顯子3擴增片段在安慶六白豬

3、、圩豬和大白豬群體發(fā)現(xiàn)1個SNP，為LIFg.C6646T、在圩豬和大白豬群體發(fā)現(xiàn)1個SNP，為LIFg.C6988T。
　　(2)群體遺傳學(xué)分析結(jié)果表明：LIFg.C5709T在安慶六白豬群體中只檢測到2種基因型（CC、CT），其中CC和CT基因型頻率分別為70.71％、29.29%，該位點在安慶六白豬群體的多態(tài)信息含量（PIC）為0.2188，處于低度多態(tài)，卡方適合性檢驗p值大于0.05，處于Hardy-Weinberg平衡狀

4、態(tài)；LIFg.C6646T在安慶六白豬、圩豬和大白豬群體中均檢測到3種基因型（AA、AB和BB），其中AA基因型頻率在3個群體中分別為47.47%、57.14%和50.62%，AB基因型頻率分別為42.42%、35.16%、35.80%， BB基因型頻率分別為10.11%、7.70%、13.58%，該位點在3個群體的多態(tài)信息含量（PIC）分別為0.3377、0.3064、0.3383，在該位點均處于中度多態(tài)，卡方適合性檢驗p值均大于0.

5、05，處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)；LIFg.C6988T在圩豬和大白豬群體中均檢測到3種基因型（DD、DE和EE），其中DD基因型頻率在這2個群體中分別為45.05%、45.91%，DE基因型頻率分別為32.97%、39.51%，EE基因型頻率分別為21.98%、13.58%，該位點在圩豬和大白豬群體的多態(tài)信息含量（PIC）分別為0.3613、0.3457，均處于中度多態(tài)，卡方適合性檢驗 p值均大于0.05，處于Hardy

6、-Weinberg平衡狀態(tài)。
　　(3)LIF基因突變位點與繁殖母豬產(chǎn)仔性狀的相關(guān)性分析：
　　LIFg.C5709T位點：基因型對安慶六白豬初產(chǎn)母豬和經(jīng)產(chǎn)母豬總產(chǎn)仔數(shù)(TNB)和產(chǎn)活仔數(shù)(NBA)均無顯著影響，但均存在CC型高于CT型的趨勢。
　　LIFg.C6646T位點：安慶六白豬初、經(jīng)產(chǎn)母豬群體BB基因型的TBA和NBA均極顯著高于AB和AA基因型（P<0.01)，初產(chǎn)母豬群體AB基因型極顯著高于AA基因型(P

7、<0.01)。大白豬群體初產(chǎn)母豬AA基因型的TNB和NBA均極顯著高于AB和BB基因型(P<0.01)；經(jīng)產(chǎn)母豬AA基因型TNB顯著高于AB基因型(P<0.05)，AA基因型NBA極顯著高于AB基因型(P<0.01)。
　　LIFg.C6988T位點：圩豬初、經(jīng)產(chǎn)母豬群體 DD基因型TNB和NBA極顯著高于DE和EE基因型（P<0.01）。大白豬初產(chǎn)母豬群體DD基因型TNB和NBA極顯著高于DE和EE基因型（P<0.01）；經(jīng)產(chǎn)母