豬LXRα、HNF-4α基因多態(tài)性及其與生長性狀的相關(guān)性分析.pdf

1、肝X受體α（LXRα）是一類與脂類代謝有關(guān)的核受體，是重要的脂質(zhì)傳感器，其主要功能是通過其相應(yīng)的配體過氧化物酶增殖受體（PPAR）和維甲酸X受體（RXR）等形成異二聚體，然后在特定的激活劑（氧化固醇類）的激活下調(diào)控靶基因的轉(zhuǎn)錄，從而影響機(jī)體內(nèi)的脂類和糖類的代謝，并且通過調(diào)節(jié)脂肪酸的合成來調(diào)控脂質(zhì)的動(dòng)態(tài)平衡。肝細(xì)胞核因子-4α（HNF-4α）是肝細(xì)胞核因子（hepatocyte nuclearfactor，HNF）家族成員之一，可在肝臟內(nèi)

2、高表達(dá)，該家族基因?qū)Ω渭?xì)胞的分化調(diào)控起關(guān)鍵作用，同時(shí)參與肝臟糖、脂代謝相關(guān)基因特異性表達(dá)的調(diào)控。LXRα基因和HNF-4α基因參與調(diào)節(jié)生命代謝活動(dòng)的諸多方面并且對(duì)動(dòng)物生長發(fā)育過程起著重要作用。
　　 本研究以長白豬、法系大白豬、野豬、大民豬和北京黑豬為實(shí)驗(yàn)材料，采用PCR方法克隆了野豬LXRα基因和HNF-4α基因的全長編碼區(qū)序列以及LXRα基因內(nèi)含子1、2、3、4、5、7、8；采用生物信息學(xué)的方法對(duì)LXRα基因和HNF-4α基

3、因結(jié)構(gòu)功能域及分子進(jìn)化進(jìn)行分析；采用PCR-SSCP的方法分析LXRα基因和HNF-4α基因單核苷酸多態(tài)性并探討不同等位基因在豬種中的分布規(guī)律及其與初生重、斷奶重、出生體長、出生體高、出生胸圍、肌纖維直徑、肌纖維密度和肌纖維橫截面積的相關(guān)性分析。主要研究結(jié)果如下：
　　 1.野豬LXRα基因完整編碼區(qū)長1344bp，編碼447個(gè)氨基酸。LXRα基因進(jìn)化較保守，豬與牛的同源性最高（96.87％），與鴨同源性最低（70.47％）。<

4、br>　　 2.野豬HNF-4α基因完整編碼區(qū)長1425bp，編碼474個(gè)氨基酸。HNF-4α進(jìn)化較保守，豬與人的同源性最高（97.68％），與斑馬魚同源性最低（81.01％）
　　 3.LXRα基因的內(nèi)含子1、2、3、4、5、7、8分別長646bp、689bp、748bp、211bp、304bp、680bp。
　　 4.在LXRα基因的第二內(nèi)含子和第四外顯子上共尋找到5個(gè)單核苷酸突變和1個(gè)2bp的插入/缺失，其中在第

5、四外顯子上的兩處單核苷酸突變均為同義突變。群體遺傳學(xué)分析表明，所檢測的3個(gè)位點(diǎn)在5個(gè)品種間基因型的分布均存在著極顯著的差異（P<0.01）。
　　 5.采用PCR-SSCP方法在HNF-4α基因的第二內(nèi)含子、第八外顯子、第八內(nèi)含子和第九外顯子上共尋找到5個(gè)單核苷酸突變。其中在第八外顯子上的第101978堿基處單核苷酸突變C→T為同義突變，第102001堿基處單核苷酸突變G→A為錯(cuò)義突變，氨基酸變化為G→E，第九外顯子上的單核苷酸

6、突變T→C為同義突變。群體遺傳學(xué)分析表明，所檢測的4個(gè)位點(diǎn)在5個(gè)品種間基因型的分布均存在著極顯著的差異（P<0.01）。
　　 6.LXRα基因1133多態(tài)位點(diǎn)基因型對(duì)法系大白豬的出生胸圍顯著相關(guān)（P<0.05），TB4多態(tài)位點(diǎn)基因型對(duì)法系大白豬的斷奶重和出生體長顯著相關(guān)（P<0.05）。HNF-4α基因SH1多態(tài)位點(diǎn)基因型對(duì)法系大白豬的出生體長極顯著相關(guān)（P<0.01），SH2多態(tài)位點(diǎn)基因型對(duì)法系大白豬的初生重顯著相關(guān)（P<0