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文檔簡介
1、癌癥是全球一個主要死亡原因,在2012年造成820萬人死亡。導(dǎo)致發(fā)生癌癥的因素種類繁多而且數(shù)據(jù)量巨大,本文基于導(dǎo)致患癌的外因素和基因設(shè)計分析系統(tǒng),以提高癌癥研究中的分析效率。
本文所做的工作包括以下三個方面:
首先,基于導(dǎo)致癌癥的外因素設(shè)計分析系統(tǒng)。將外因素的分析過程分別特征提取和分類預(yù)測進行系統(tǒng)設(shè)計。該系統(tǒng)利用Cox比例風(fēng)險回歸模型從諸多癌癥患者的描述屬性中提取最相關(guān)的特征組成特征集,然后利用最小二乘法支持向量機預(yù)
2、測具有某類特征的癌癥患者經(jīng)過一段時間后癌癥可能惡化導(dǎo)致死亡或者惡化程度仍然可控。實驗結(jié)果表明,該系統(tǒng)能準確地預(yù)測癌癥經(jīng)過一段時間的發(fā)展后所導(dǎo)致的結(jié)果。
其次,本文基于系統(tǒng)發(fā)育樹設(shè)計了癌癥復(fù)發(fā)模式分析系統(tǒng)。該系統(tǒng)利用高通量測序獲取癌癥樣本的原始數(shù)據(jù),然后對數(shù)據(jù)進行預(yù)處理及格式轉(zhuǎn)換,最后生成系統(tǒng)發(fā)育樹。分析結(jié)果表明,腫瘤內(nèi)部轉(zhuǎn)移起源和多中心起源兩種腫瘤復(fù)發(fā)模式在病人中間同時存在,并且這一結(jié)果與臨床病理分析結(jié)果完全一致,證明了分子進
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