天然二倍體與四倍體泥鰍細(xì)胞色素b序列的比較和多樣性分析.pdf

1、本研究以泥鰍Misgurnus anguillicaudaats為研究對(duì)象，對(duì)天然二倍體泥鰍和四倍體泥鰍細(xì)胞色素b基因序列進(jìn)行了比較，探討其進(jìn)化關(guān)系。另外增加研究了泥鰍的分子地理學(xué)分布。主要內(nèi)容如下： 1.湖北省天然二倍體泥鰍與四倍體泥鰍的細(xì)胞色素b序列比較和進(jìn)化分析。通過(guò)對(duì)天然二倍體泥鰍與四倍體泥鰍的細(xì)胞色素b序列進(jìn)行擴(kuò)增、測(cè)序，結(jié)果顯示所測(cè)泥鰍樣本細(xì)胞色素b基因大小均為1140bp，在1140個(gè)堿基位點(diǎn)中，45個(gè)變異位點(diǎn)，其

2、中二倍體之間有23個(gè)變異位點(diǎn)，四倍體之間有14個(gè)變異位點(diǎn)。由二倍體泥鰍和四倍體泥鰍Cyt b基因序列推導(dǎo)氨基酸序列，均獲得380個(gè)氨基酸。通過(guò)比對(duì)，樣本間有18個(gè)氨基酸發(fā)生替代，其中10個(gè)發(fā)生在二倍體之間，8個(gè)發(fā)生在四倍體之間。在所有泥鰍樣本中，核苷酸兩兩序列間的遺傳距離變化范圍為0.001-0.378(包括外群)，去除外群，二倍體與四倍體之間的遺傳距離變化范圍為0.001-0.025。經(jīng)AMOVA分析，二倍體之間(Fst=0.2529

3、，p>0.05)和四倍體之間均無(wú)明顯差異(Fst=0.0564，p>0.05)，但是二倍體與四倍體之間有明顯差異(Fst=0.7634，P<0.05)。 利用Cyt b基因構(gòu)建二倍體泥鰍和四倍體泥鰍的NJ(鄰接法)分子系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)和MP(最大簡(jiǎn)約法)分子系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)，兩個(gè)系統(tǒng)樹(shù)具有相似的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)和置信度。在系統(tǒng)樹(shù)中，二倍體泥鰍與四倍體泥鰍明顯處于兩個(gè)分枝，二倍體泥鰍(恩施、陽(yáng)新、天門(mén)、十堰、秭歸)為一枝，四倍體泥鰍(武漢、孝感、赤壁

4、、沙市)為另一枝，二倍體泥鰍在進(jìn)化樹(shù)的底端，而四倍體泥鰍在進(jìn)化樹(shù)的頂端。這表明在自然界中，二倍體泥鰍的存在早于四倍體泥鰍，四倍體泥鰍可能是由二倍體泥鰍進(jìn)化而來(lái)。這是第一次通過(guò)mtDNA Cyt b基因研究天然多倍體泥鰍的進(jìn)化關(guān)系。 2.泥鰍的分子生物地理學(xué)分布。本實(shí)驗(yàn)除以湖北省泥鰍為樣品外，還增加了湖南、山東、重慶等省的泥鰍為樣品。通過(guò)對(duì)泥鰍樣品Cyt b基因序列擴(kuò)增、測(cè)序，結(jié)果顯示所測(cè)泥鰍樣本細(xì)胞色素b基因大小也為1140bp